В 1912 году Бадаев был избран депутатом IV Государственной думы от рабочих. Выезжал за границу для участия в партийных совещаниях, где встречался с Лениным. В 1912—1914 годах как депутат Думы был зиц-учредителем и зиц-редактором газеты «Правда», публиковавшей статьи Ленина, Сталина, Каменева, Плеханова, Демьяна Бедного, Максима Горького, Розы Люксембург и многих других известных социал-демократов, позже большевиков, в том числе находящихся в ссылках и эмиграции. Кстати, секретарём редакции в этот период работал Вячеслав Молотов, будущий нарком иностранных дел СССР, соратник и друг Сталина, его правая рука, а литературный отдел возглавлял Максим Горький.
В 1914 году Бадаев вместе с другими членами большевистской фракции Думы был арестован и по решению суда отправлен в ссылку в Туруханский край. Освобождён Февральской революцией. Участвовал в Октябрьских событиях. В годы Гражданской войны занимался продовольственным снабжением Петрограда, смог наладить поставки продовольствия, и его имя присвоили складам, построенным в 1914 году купцом 1-й гильдии С. И. Растеряевым.
Бадаевские склады помнятся многим, тем, что время Великой Отечественной войны в результате массированных авианалётов германской авиации они сгорели, что было воспринято ленинградцами, а впоследствии и всей страной, как главная причина голода в Ленинграде во время блокады. Но это – миф. Возможно, он был пущен, чтобы оправдать низкие нормы выдачи продуктов. На самом деле, там хранилось менее 5% городских запасов хлеба и 4% сахара, причём после ликвидации пожара примерно треть продуктов – горелую и залитую водой муку, и горелый сахар, – удалось собрать и переработать на пищевых предприятиях города.
С 1925 года и до конца жизни А. Е. Бадаев был членом ЦК ВКП(б), занимал должности председателя Центросоюза, заместителя наркома пищевой промышленности РСФСР, потом наркома. В 1934 году его имя было присвоено знаменитому московскому Трёхгорному пивоваренному заводу, который сначала неофициально, а в последствии и официально стали называть Бадаевским пивзаводом. С 1938 года работал председателем Президиума Верховного Совета РСФСР и заместителем председателя Президиума Верховного Совета СССР.
В 1943 году, в возрасте в 60 лет, «…дискредитировал себя недостойным поведением в ходе государственного визита в Монголию и Туву… Будучи пьяным, терял чувство всякого личного достоинства и в своем антиморальном поведении опускался до того, что неоднократно приставал к женщинам и требовал, чтобы "доставили ему баб" для разврата», в связи с чем был освобождён от занимаемой должности постановлением сессии Верховного Совета РСФСР и назначен руководителем треста «Главпиво» («Википедия»). Умер в 1951 году.