В 1871 году Морган становится партнером в финансовой компании «Дрексел, Морган и Ко», а после кончины в 1893 году Энтони Дрексела станет полноправным ее владельцем. Контора реорганизуется в банкирский дом, в состав которого входят банки Филадельфии, Парижа и Лондона. К концу XIX века банкирский дом Моргана занимает первое место в мире по объемам капитала. За относительно короткий период времени Джон Морган посредством своего банка участвует создании знаменитых промышленных компаний США: «Ю. Эс. Стил корпорейшн», «Дженерал Электрик», «Америкэн Телефон энд Телеграф», Вестингхауз электрик корпрейшн» и некоторых других. Друзья и враги называли его Юпитером – в честь бога неба и дневного света, отца всех богов. Слияния и скупка компаний становятся фирменным стилем Д.П. Моргана. Этому дают даже название – морганизация. В 1900 году Морган предложил Э. Карнеги приобрести его сталеплавильный бизнес. Карнеги согласился отдать его за 487 миллионов долларов. В начале следующего года в США появилась первая в мире компания с капитализацией более одного миллиарда долларов – U.S. Steel Corporation. Подвергся морганизации и бизнес знаменитого Т. Эдисона – изобретателя лампы накаливания. В результате объединения с конкурирующей фирмой возник гигант General Electric. Заодно Морган провел уличное освещение по Манхэттену.
Успеху Моргана сопутствовал и общий подъем промышленного производства. Капитализация всех акций и облигаций с 1890 по 1915 год увеличилось в США с 200 миллионов до 20 миллиардов. Огромными темпами строились железные дороги, шахты и рудники, заводы и фабрики. В такой ситуации деньги Джона Моргана, и таких как он финансистов с Уолл-Стрит, стали как кровь для кровеносной системы американской тяжелой индустрии.
Как и большинство финансовых магнатов, он собирает произведения искусства, книги, да и вообще ценные вещи, как, например, редкие камни. Но и это не все, Морган слыл заядлым яхтсменом и владел несколькими дорогими яхтами. Его коллекции уникальных книг хватило на целую публичную библиотеку, открытую в 1924 году в Нью-Йорке сыном. Морган щедро выделяет средства Американскому музею естественной истории, Тринити-колледжу и Гарвардскому университету. По всей Америке финансирует он трудовые школы – специальные учебные заведения для рабочей молодежи. Музею «Метрополитен» кроме денег достаются и произведения искусства – живопись, графика и гравюры, а музею естественной Истории – его камни. Личная коллекция живописи Моргана оценивалась в 50 миллионов долларов. Д.П. Морган любил благотворительность. Он выдал инженеру Н. Тесле деньги на его опыты по беспроводной передаче электрической энергии. Фотографу Э. Кертису банкир выделил средства на серию фотографий «Коренные жители Америки»