Потом они начали штурм цитадели, а в ней было около 400 всадников мусульман, которые прилагали все усилия, защищая крепость 12 дней, избив множество неверных и городских жителей. Были, правда, убиты и некоторые из осаждённых, но они не переставали биться до тех пор, пока неприятели не продвинулись к ним ближе. К тому же к стене крепостной подошли сапёры и подкопали её. Загорелся бой еще упорнее. Мусульмане, находившиеся в крепости, метали в штурмующих все что находили: камни, огонь и стрелы. Чингисхан разгневался и вызвал подкрепление в один из дней, на следующий он двинул их на очередной штурм с раннего утра. Упорствовали в бою, но уже утомились находившиеся в крепости, а неприятелей надвигалось всё больше и пришло на них столько, что нельзя было устоять против них. Победили неверные и ворвались в цитадель. Бывшие в ней мусульмане бились с ними до тех пор, пока не были перебиты все до последнего. Управившись с крепостью, Чингис-Хан приказал составить для него список главных лиц города и старшин. Сделали это и, когда ему представили список, то он приказал привести их. Явились они, и он сказал:
– Требую от вас серебро, которое вам продал Хорезмшах; ведь оно принадлежит мне, отобрано у моих сторонников и находится у вас.
Все предоставили ему серебро сколько у кого было. Затем он приказал им выйти из города, и они вышли из города, лишившись своего имущества. У них не осталось ничего, кроме платья, в которое были одеты. Вошли неверные в город, ограбили его и убили, кого нашли в нем. Чингис-Хан окружил мусульман и приказал своим сторонникам разделить их между собой. Татары поделили их, и был день ужасный, вследствие обилия плача мужчин, женщин и детей. Разбрелись жители во все стороны и были растерзаны в лохмотья. Женщин Татары разделили между собой. На утро Бухара оказалась разрушенной до своего основания, как будто её и не было. Совершали они с женщинами великий грех, а люди смотрели и плакали, но не имели возможности постоять за себя. Иной из них, не вынося унижения, предпочитал смерть и бился до тех пор, пока не был убит. В числе тех, которые поступили так и предпочли быть убитыми, чтобы не видеть того позора, который постиг мусульман, находился законовед и имам Рукнеддин имамзаде и сын его. Увидев, что делалось с женским полом, они бились оба до тех пор, пока сами не были убиты. Так поступил и кади Садреддинхан. Кто сдавался, того брали в плен. Город, училища и мечети подожгли, мучили и истязали народ, вымогали деньги. Потом они отправились к Самарканду, удостоверившись в слабости Хорезмшаха перед ними, пришли туда, где он был, между Термезом и Балхом. Они вели с собой пленными уцелевших жителей Бухары, которые шли за ними пешком, в самом гнусном виде. Всякий, кто уставал или изнемогал от ходьбы был убит. Подойдя к Самарканду, они выслали вперёд конницу, а пеших, пленных и обозы оставили за собой, поручив им подвигаться мало по малу к городу.