В ночь на 3 ноября флот планировал использовать уже опробованную в прошлую ночь схему снабжения Эльтигенского плацдарма. Однако этому помешали сразу несколько обстоятельств: начавшее активное противодействие немецкого флота, огонь немецких береговых батарей, а также сильное волнение на море. В течение ночи удалось доставить на западный берег 751 человека, 5 76-мм и 2 45-мм пушки, 2 120-мм миномета, 19,8 тонны боеприпасов и 5 тонн продовольствия.
В 21.40–22.40 летающие лодки МБР-2 из 119-го МРАП и 82-й ОМРАЭ, базировавшиеся в Поти, выполнили 6 самолето-вылетов на подавление прожекторов и огня батарей. Тем не менее артиллерией были расстреляны, а затем выброшены сильными волнами на берег десантный бот № 23, моторные баркасы № 2 и № 50 и два гребных баркаса. На мине подорвался бронекатер БКА № 37 старшего лейтенанта Ивана Запорожца. Погибли 19 моряков, включая командира бронекатера, и примерно 40 десантников.
«Сильные атаки русской штурмовой авиации»
3 ноября погода над Керченским проливом резко ухудшилась: пошли дожди, а советские аэродромы окутали туманы. В связи с этим интенсивность действий авиации резко снизилась. 230-я ШАД выполнила только 39 вылетов, из которых 27 пришлось на штурмовики. С малой высоты они бомбили и обстреливали различные цели к северо-востоку от Керчи. С задания не вернулись два Ил-2, еще пара получила сильные повреждения от огня с земли и совершила вынужденные посадки на фюзеляж на восточном берегу пролива. А 214-я ШАД в боевой работе не участвовала вовсе, поскольку погода не позволяла ее самолетам подняться в воздух.
Всего же 4-я ВА в этот день ограничилась 95, а ВВС ЧФ – 33 вылетами. Заявки на сбитые самолеты (например, летчики 11-го ГИАП доложили о двух сбитых Ме-109 и одном Ю-87) документами противника не подтверждаются.
Пилоты 5./JG52 заявили лишь о двух победах. Фельдфебель Фённекольд сообщил, что в 11.20 восточнее села Баксы (ныне Глазовка), в 9 км северо-восточнее Керчи, сбил биплан Р-5. Фактически же это был У-2 из 889-го НЛБАП, корректировавший огонь артиллерии. Затем в 14.32 лейтенант Вальтер Вольфрум записал на счет еще один Як-1.
Днем Ju-87 из III./SG3 осуществили налет на Эльтигенский плацдарм, где румынская пехота при поддержке штурмовых орудий несколько раз атаковала позиции десантников. При этом последние обстреливали «Штуки», пикировавшие на цели через имевшиеся разрывы в облачности, из двух трофейных 37-мм зенитных пушек.