Фортом 35-я батарея не являлась, но представляла собой уникальное военно-инженерное сооружение. Батарея была вооружена двумя двухорудийными башенными установками «МБ-2-12», выпущенными Ленинградским (Обуховским) металлическим заводом (орудийные станки и часть механизмов сняты из башен линкора «Полтава» Балтийского флота). Батарея состояла из двух многоуровневых орудийных блоков с железобетонными стенами от двух до трёх метров толщиной. Внутри первой башни на двух этажах были расположены погреба для боеприпасов, помещения для бытовых и служебных надобностей. Внутри массива второй башни – силовая станция и центральный дальномерный пост с приборами управления стрельбой.
Береговая батарея №35 имела сверхсовременную по меркам своего времени противоударную и противохимическую систему защиты. Южнее в двух километрах в целях маскировки была построена «ложная» 35-я ББ, помещения которой использовались для охранных и обслуживающих подразделений. Вокруг батареи находились долговременные огневые точки (ДОТы) и укрепления для стрелкового огня.
Первые боевые выстрелы 35-я ББ осуществила 7 ноября 1941 года, в начале обороны Севастополя. За два месяца артиллеристы произвели более 300 выстрелов каждым орудием, превысив норму износа на 150%, что привело к полному износу орудийных стволов. 1 декабря 1941 года начались работы, имевшие целью замену орудийных стволов первой башни, вторая продолжала действовать.
17 декабря 1941 года противник начал второй штурм города. 35-я ББ вела интенсивный обстрел позиций вермахта. Вторая башня вышла из строя по причине внутреннего взрыва, как показало проведенное позже расследование, из-за преждевременного воспламенения порохового заряда при незакрытом затворе, что привело к гибели 40 человек орудийной команды. Бронебашня была восстановлена в боевых условиях всего за 2,5 месяца силами рабочих Севастопольского морского завода им. С. Орджоникидзе. В июне 1942 года 35-я ББ вела массированный огонь по германским войскам. После того, как оказалась в окружении и была взорвана 30-я береговая батарея (форт «Максим Горький I», такое наименование она получила у немцев) – брат-близнец 35-й батареи («Максим Горький II»), 35-я ББ оставалась единственным резервом тяжелой артиллерии Севастопольского Оборонительного Района (СОР). Противник наносил по её территории мощные авиационные удары. Один из налетов 23 июня 1942 года стал причиной выхода из строя 1-й бронебашни. В конце июня 35-я ББ стала последним рубежом обороны и местом дислокации командных пунктов Приморской армии и СОР.