Но когда следственному комитету стало все же известно об участии Глинки в ранних декабристских обществах, он был арестован, содержался в Петропавловской крепости, а в июне 1826 г. был исключен из военной службы и сослан в Петрозаводск на должность советника Олонецкого губернского правления. Карельская ссылка дала творчеству Глинки новые темы (поэма «Дева карельских лесов», 1828, отрывок опубликован в 1832, полностью в 1939), но очень угнетала его одиночеством.
В 1830 г. Глинка был переведен в Тверь. Это, конечно, не столица, но и не Олонецк. Здесь он, имея 43 года от роду, вскоре женился на далеко не юной, 35-летней Авдотье Павловне Голенищевой-Кутузовой, отец которой недавно умер, и препятствий для брака родовитой и богатой наследницы, влюбленной в литературу и упражнявшейся в стихотворстве, с безродным и очень бедным чиновником, прикосновенным к заговору, зато прославленным литератором, не было. В 1830 г. Глинка напечатал большую поэму «Карелия, или Заключение Марфы Иоанновны Романовой», в которой описания северной природы были едва ли не важнее исторического сюжета.
С 1832 по 1835 г. Глинки жили в Орле, где бывший декабрист вынужденно служил. Но как только он смог выйти в отставку, супруги сразу поселились в Москве. Еще до 1825 г. Глинка активно писал переложения псалмов, собранные в «Опытах священной поэзии» (СПб., 1826) и назидательные произведения – «Опыты аллегорий, или иносказательных описаний, в стихах и прозе» (СПб., 1826). С годами духовные, мистические поиски его, которые поддерживала и Авдотья Павловна, отразились в «Духовных стихотворениях» (1839) и поэмах «Иов. Свободное подражание священной книге Иова» (СПб., 1869), «Видение Макария Великого» (1840-е, опубликована 2013) и «Таинственная капля» (Берлин, 1861).
Не оставлял он, впрочем, и другие темы. Потрясенный смертью А.С. Пушкина, он написал стихотворные воспоминания «О пиитической жизни Пушкина» (М., 1837), а после торжественного празднования в 1837 г. 25-летия победы на Бородинском поле начал работу над «Очерками Бородинского сражения» (М., 1839).
С 1853 г. супруги Глинки жили в Петербурге. Среди наиболее известных стихотворений этого времен было написанное в 1854 г. в связи с Крымской войной стихотворение «Ура! На трех ударим разом» с агрессивными шапкозакидательными интонациями, в которых откликались воспоминания о военных успехах России 1812–1815 гг. Духовные искания привели Глинок в это время к спиритизму, который вырос на почве предшествовавшего ему мистицизма.