Томат – однолетнее растение из семейства пасленовых, его корневая система сильно разветвлена. Стебель прямостоячий (штамбовые сорта) или полегающий (обыкновенные сорта). Кусты бывают детерминантными и индетерминантными. Первый тип встречается у ранне- и среднеспелых сортов, у них на вершине главного побега образуется последнее соцветие, которое ограничивает его рост. Поэтому главный стебель достигает высоты 30–65 см. У растений второго типа соцветия образуются непрерывно через каждые 3–4 листа, а потому главный стебель может вырасти от 1 до 5 м в высоту. Этот тип чаще встречается у позднеспелых сортов томата.
Данная культура самоопыляющаяся, цветки желтые, невзрачные, мелкие. Плод – сочная ягода с двумя или несколькими гнездами, массой от 5 до 1000 г, самой различной формы – от плоской до цилиндрической. Поверхность плода бывает гладкой или ребристой с разной степенью выраженности, а цвет – красным, желтым, белым, черным, зелено-бурым или варьироваться от розового до темно-малинового, от светло-желтого до оранжевого.
Семена томата имеют яйцевидную, почковидную или треугольную форму, мелкие, опушенные, плоские, желтые или желтовато-серые.