Математические модели в естественнонаучном образовании. Том I - страница 5

 flhivdata.m – содержит последовательности ДНК гена оболочки вируса иммунодефицита человека из «случая стоматолога во Флориде»;

 genemap.m – моделирует данные тестового скрещивания для проекта генетического картирования, используя гены мухи или мыши;

 genesim.m – производит временной график частоты аллелей гена в популяции фиксированного размера; относительные значения приспособленности для генотипов могут быть установлены для моделирования естественного отбора;

 informative.m – функция находит участки в выровненных последовательностях ДНК, которые информативны для метода максимальной экономии;

 longterm.m – рисует диаграмму бифуркации для модели с одной популяцией, показывая долгосрочное поведение по мере изменения значения одного параметра;

 markovJC.m и markovK2.m – эти функции осуществляют получение марковской матрицы Джукса-Кантора или 2-параметрической модели Кимуры с заданными значениями параметров;

 mutate.m и mutatef.m – моделирует мутации последовательности ДНК по марковской модели замещения оснований; вторая программа является функциональной версией первой;

 nj.m – функция реализует алгоритм присоединения соседей для построения дерева из массива расстояний;

 onepop.m – отображает графики итераций модели с одной популяцией;

 primatedata.m – содержит последовательности митохондриальной ДНК из 12 приматов, а также вычисленные расстояния между ними;

 seqdata.mat – содержит смоделированные данные последовательности ДНК;

 seqgen.m – функция генерирует последовательности ДНК с заданной длиной и распределением оснований;

 sir.m – отображает итерации эпидемиологической модели SIR, включая графики временной и фазовой плоскости;

 twopop.m – отображает итерации 2-популяционной модели, включая графики временной и фазовой плоскости.