Когда пришло время могуллских завоеваний, уйгуры сохранили свои лучшие культурные традиции. Понимая, что сопротивление будет напрасным и приведёт только к разрушению его страны, Барчук, правитель уйгуров Куча, добровольно подчинился могуллам. Уйгурские чиновники и писцы были первыми «государственными служащими» империи Чингисхана и его потомков, они оказали благотворное цивилизационное влияние на завоевателей. Согдийский шрифт, используемый уйгурами, был принят могуллами, которые, в свою очередь, передали его маньчжурам. Наряду с кириллицей он всё ещё используется в Монголии.
Известно, что первыми людьми, заговорившими на могуллском языке, были кидани. Упоминаемый с V века нашей эры, этот народ, живший в лесах Маньчжурии, имел контакты как с турками, так и с уйгурами. В 924 году их лидер Абаоджи нанёс поражение киргизам и предложил уйгурам возможность переселения в их бывшую страну. Кидани завоевали северный Китай, которым они правили под династическим именем Ляо (907—1125), пока они не были изгнаны чученами, также происходящими из Маньчжурии, которые основали династию Цзинь (Чучен) (1115—1234) в северном Китае, которая в свою очередь была заменена еще одним алтайским народом – могуллами. Катай, ранняя западная деноминация Китая (Кътай), происходит от названия Кидань, которая объединяет большое количество различных племён. Распространение этого имени, которое до сих пор используется в русском языке для обозначения Китая, является лишь одним из признаков необычайного влияния киданей на историю.
Изгнанные из Китая чученами в 1124 году, некоторые китанцы двинулись на запад под предводительством Елю Даши и создали государство Карахитан иначе Каракитай (Чёрный Хитай, или Западный Ляо). Его центр лежал в Семиречье и Чуйской долине, где находился город Баласагун. Основанный согдийцами, Баласагун к тому времени был оккупирован мусульманскими Караханидами (Караханидами), турецким народом, тесно связанным с уйгурами и правящий дом которого, вероятно, происходил от карлуков (карлыков). Караханиды, ставшие мусульманами в середине X века, правили как Семиречьем, так и Таримской котловиной к югу от Тянь-Шаня. В то время как Баласагун оставался резиденцией их главного правителя, Кашгар, похоже, служил религиозным и культурным мегаполисом. В 992 году они заняли Бухару, ранее являвшуюся столицей иранской династии Саманидов (819—1005 годы), под чьим благосклонным правлением города