Вторая чеченская война, начавшаяся осенью 1999 года, и продолжившаяся вплоть до лета 2000-го, ее последствия, как важный фактор внутренней политики первых лет президентства Путина, встретила негласную поддержку значительного числа тех, кто причислял себя к левому флангу российской политики.
Движение «Трудовая Россия» Виктора Анпилова решительно осудило чеченскую кампанию Путина, присоединив свой голос к меньшинству левого сегмента российской политики, руководствуясь базовыми принципами ленинской национальной политики, марксистского понимания национального вопроса и пролетарского интернационализма. Такую же оценку в 1995–1996 годах «Трудовая Россия» дала Первой Чеченской войне, развязанной окружением Ельцина.
В статье «Реванш партии войны» (декабрь 1999 г.) Анпилов пишет: «Оставаясь на позициях пролетарского интернационализма, что и было записано в Манифесте Сталинского блока, мы обязаны были безо всякой оглядки разоблачить войну на Кавказе как продолжение преступного передела собственности советских народов, как войну нефтяных магнатов за контроль и неслыханное обогащение на транзите каспийской нефти. Человеку труда в любой части России от той нефти ничего не перепадет, а сыновей рабочих и крестьян в угоду безродных банкиров будут убивать. Пусть Чубайс, Сванидзе и прочая обвиняют кого угодно в "предательских ударах в спину российской армии". Мы – за прекращение безумной бойни и за вывод российских войск с территории Чечни. Хватит прикрываться словесами о борьбе с международным терроризмом, как это делает мировой разбойник – США! Пусть чеченцы самоопределятся: хотят отделиться от России – вольному воля!»
И через месяц (январь 2000 г.), накануне президентских выборов, позиция лидера «Трудовой России» неизменна. В статье «Собчачьи уши "патриота" Путина», он пишет: «Позиция Совета Федерации укрепила намерение Путина добиваться решения конфликта на Кавказе жестким военным путем. Мочить всех подряд! А ради чего? Ради того, чтобы кремлевская мафия задушила чеченскую мафию, угрожавшую полностью отрезать Кремль от бакинской нефти, которая потекла бы тогда не через российскую территорию, а через грузинскую и турецкую – на Запад. Короче, война развязана и идет в интересах мафии, а рабочие и крестьяне расплачиваются за нее кровью своих сынов. И все это под аплодисменты "патриотической" оппозиции».