Как гласят старые документы Атуэй развязал против Веласкеса партизанскую войну и около года держал завоевателей в страхе. Воины таино прятались в горах на востоке Кубы покинув свои деревни, позже все кубинские буканьеро, революционеры и партизаны, включая Фиделя Кастро через 500 лет будут повторять эти манёвры в горах. Испанцы не могли быстро передвигаться на лошадях в скалистых горах, а их арбалеты были успешны в бою на открытой местности. Атуэй с воинами таино окружали колонны конкистадоров и нападали на них из засад, наносили удары своими копьями и стрелами, потом быстро исчезали в знакомой местности и потом опять неожиданно нападали на врага в другом месте. Испанцам приходилось отступать, неся большие потери и даже держать оборону в недавно построенном форте в Баракоа.
Кубинские народные легенды гласят, что Атуэя предал один из своих воинов задобренный испанцами. Он привёл отряд врагов к убежищу Атуэя в горах, и он сдался в плен в обмен на обещание Веласкеса отпустить его воинов. 12 февраля 1512 года Атуэй был сожжён заживо на костре возле селения Яра недалеко от Мансанильо.
Как гласит старая легенда монах-францисканец сказал ему перед казнью, что если он примет обряд крещения, то попадёт в рай. Атуэй спросил в ответ у монаха, а попадут ли в рай его противники. Монах ответил, что, да и вы там когда-нибудь опять встретитесь. Тогда Атуэй ответил, что лучше ему оказаться в аду, чтобы только не встречаться с этими жестокими и злыми людьми. Эту легенду с детства знает каждый кубинский ребёнок и она увековечена во всех научных трудах по истории острова. После смерти Атуэя и покорения Кубы началось жестокое истребление индейцев племени таино.
«Жестокость, которую я здесь видел,
Никогда не должна повториться».
Бартоломео де Лас Касас
Тех, кто выжил отправляли на работы в золотые прииски или на расчистку земель под поля.
Бартоломео де Лас Касас родился в 1474 году, а в 1502 году прибыл на Эспаньолу и стал первым священником, рукоположенным в Новом Свете. Он вёл дневники с описаниями событий тех времён, участвовал в завоевании Кубы, а в 1514 году выступил против жестокостей в отношении коренного населения Америки. Осуждая испанцев, он подал прошение королю Карлу V, но тот никак на него не отреагировал. По иронии судьбы именно святой отец Лас Касас посоветовал испанцам завозить рабов из Африки взамен истреблённых таино, в конце жизни он очень об этом сожалел. Позже он вступил в орден монахов-доминиканцев и написал «