Нет целостного учения о законных интересах налогоплательщика как самостоятельного раздела науки налогового права. В учебниках по финансовому и налоговому праву даже очень авторитетных юридических школ тема законных интересов налогоплательщиков не раскрывается либо совсем, либо находится в тени субъективных прав налогоплательщиков. Этой темы нет в учебных программах вузов, в учебных пособиях, лекциях и учебниках. У сегодняшних студентов имеются весьма отдаленные представления о законных интересах налогоплательщиков. Что же говорить про студентов, если и практические работники, должностные лица налоговых и финансовых органов, судьи не всегда понимают действительный смысл этой важнейшей для налогового права правовой категории. Это видно по тем судебным актам, которые принимаются в разрешение налоговых споров, научным публикациям, содержащим недоумения, возмущения и различного рода несогласия с такими обескураживающими решениями. С другой стороны, откуда возьмется иной правоприменительный подход, если финансово-правовая наука ничего не предлагает взамен. По теме законных интересов налогоплательщика не проводятся научные конференции, вебинары и круглые столы, в отличие от обсуждения проблем налогового контроля, налоговой ответственности и других институтов налогового права, которым уделяется достаточно много внимания: пишутся многочисленные научные статьи, монографии, защищаются диссертации.
Причины данного положения коренятся, прежде всего, в особенностях исследуемой проблемы, процессе накопления знаний в данной области.
Традиционно отраслевые науки опираются на достижения общей теории права. Не исключением является и налоговое право. Вместе с тем в самой общей теории законных интересов не выработано общих подходов, хотя и нельзя не отметить успехи и существенное продвижение теоретиков. Особенно хотелось бы выделить труды В. В. Субочева, который, в свою очередь, учитывал работы А. В. Малько, Н. И. Матузова, А. И. Экимова, Г. В. Мальцева и ряда других ученых.
Большинство современных налоговедов воспринимает общетеоретические положения теории интересов как прописную истину, механически переносят положения общей теории в налоговое право, не пытаясь при этом выделить отраслевые особенности исследуемого явления, обусловленные финансовой, т. е. публичной, сферой их применения. В основном авторы пытаются заострить внимание на понятии законных интересов, но почти не исследуют их проблематику, препятствия в реализации и способы преодоления этих препятствий. В результате исследователям не удается выстроить действенную модель реализации законных интересов налогоплательщиков в налоговых отношениях. Мы не получаем главного ответа на вопрос: как воплотить в жизнь позитивные стремления налогоплательщиков, что для этого необходимо сделать. Кто-то и вовсе приходит к выводу о невозможности такой реализации «в связи с отсутствием правовых механизмов»