Сподвижник Магеллана астроном Руй Фалейра не смог поучаствовать в экспедиции, так как у него начались приступы безумства.
Кругосветное путешествие Фернана Магеллана началось 20 сентября 1519 года, 256 моряков отправились из порта Сан-Лукарас в сторону Канарских островов.
Суда долго двигались вдоль восточного побережья Южной Америки в поисках Южного моря, в ходе плавания был открыт архипелаг Огненная Земля, находящийся в южной части континента и весьма красивый, судя по современным фото. Португалец считал, что группа островов – составная часть «Неведомой Южной земли». Острова казались пустыми, но, когда путешественники проплывали мимо, в ночи зажглись огни. Фернан полагал, что это вулканические извержения, за что и дал архипелагу название, связанное с огнём. Но на самом деле это индейцы разжигали костры.
Корабли прошли между Патагонией и Огненной Землёй (тот пролив называется сейчас Магеллановым), затем путешественники оказались в Тихом океане.
Своим кругосветным путешествием Фернан доказал, что Земля имеет форму шара. Через 1081 день плавания, в 1522 году, в Испанию смог вернуться только один корабль «Виктория» с 18 моряками на борту, которыми командовал Элькано.
Хотя для экспедиции были заготовлены значительные запасы продовольствия, через несколько месяцев плавания продукты и вода закончились. Из-за нехватки еды мореплавателям приходилось жевать обшивку парусов, чтобы хотя бы чуть-чуть утолить голод. Путешественники потеряли 21 мореплавателя, которые умерли от истощения и цинги.
Моряки, долго не видевшие суши, добрались до Филиппин. Команда Магеллана могла запастись продовольствием и дальше отправиться в кругосветку, однако Фернан ввязался в ссору с вождём острова Мактан Лапу-Лупу. Португалец хотел показать туземцам мощь Испании и организовать военную экспедицию против Мактана. Но, к удивлению европейцев, они проиграли из-за собственной недостаточной подготовки и ловкости туземцев.
Во время сражения Магеллан был убит. Случилось это 27 апреля 1521 года.
В своё время на юге Испании Фернан Магеллан познакомился с Диего Барбозой и женился на его дочери, красавице Беатриче. У возлюбленных рождается сын, но вскоре умирает из-за болезни. Супруга Фернана пыталась родить второго ребёнка, но не выдержала родов и скончалась. Поэтому у великого путешественника не осталось потомков.