Помимо духовного лидера ХАМАС возглавляет Политбюро в составе 18 чел. В него первоначально вошли секретарь, руководители отделений в Палестине, Сирии и Иордании, командующий, официальный представитель организации. Пост председателя Политбюро (позже Исполнительного Комитета) в 1992-6 гг. занимал М. Абу Мурзук, в 1996-2016 гг. Х. Машааль и с 2017 г. И. Хания. Администрацию Сектора Газа представляет консультативный совет (Меджлис аль-шура), в который входят наиболее известные лидеры движения. С 2006 по 2017 год его возглавлял И. Хания, которого сменил Я. Синвар. До 2001 года штаб-квартира партии находилась в Аммане, в 2001-2012 г. – в Дамаске, а с 2012 г. – в Дохе.
В конце 1995 года, на переговорах ХАМАС и ООП в Каире, выявились разногласия между лидерами ХАМАС, находящимися в Газе, с одной стороны, и зарубежными центрами движения (Тегеран, Бейрут, Пакистан, Амман) – с другой. "Газовцев", возглавляемых Исмаилом Ханией и полевыми командирами, стали называть прагматиками, их оппонентов, тесно связанных с „Братьями-мусульманами” Египта – экстремистами. Их лидерами крыла являлся Халед Машааль и М. Абу Мурзук, установившие с Египтом, Катаром и Турцией. Ориентируясь на них, фракция разорвала отношения с Башаром Асадом и Ираном. После свержения президента Мурси экстремисты потеряли поддержку Египта и в 2017 году уступили руководство прагматикам. Их гражданское крыло возглавил
премьер-министр Исмаилом Хания, который предлагает сосредоточиться на внутренних проблемах и не ввязываться в посторонние конфликты. Военное крыло прагматиков во главе с Махмулом аз-Захаром и лидерами военных подразделений ХАМАС имеет давние связи с Ираном и ориентируется на него.
Справка : соучредители и союзники ХАМАС
„Крыло братьев-мусульман Западного берега реки Иордан и Сектора Газы" представляла собой отделение египетской исламистской организации «Братья-мусульмане». Она представляла собой международную религиозно-политическую ассоциацию, основанную в марте 1928 года в египетской Исмаилии. С 1933 года штаб-квартира организации была переведена в Каир. Её основатель Хасан Аль-Банна охарактеризовал движение так: салафийское движение: «ортодоксальный путь, суфийская реальность, политическая организация, спортивная группа, научное и культурное общество, хозяйственная компания и социальная идея». К концу Второй мировой войны она насчитывала около 500 тысяч членов. После смерти Хасана Аль-Банна в 1949 году. В 1950 году одним из идеологов движения стал литератор Сейд аль-Кутб (казнён в 1966 г.), который придал движению экстремистское направление и выдвинул лозунг захвата политической власти. Ассоциация имеет своих приверженцев во многих странах мира и наиболее влиятельна в Египте, Иордании, Сирии и Турции.