Обеспечение безопасности партизанских формирований являлось одним из основных направлений деятельности органов государственной безопасности СССР на оккупированной советской территории и включало в себя такие формы борьбы, как своевременное получение информации о замыслах и планах гитлеровцев; выявление проникших в ряды партизан агентов спецслужб противника; проведение мероприятий по зашифровке и маскировке районов базирования партизан; поддержание совместно с командованием партизанских формирований установленного режима, обеспечивающего сохранение в тайне секретных сведений и предупреждение их утечки к противнику; тщательная проверка новых лиц, принимаемых в партизанские отряды; выявление причин и условий, снижавших боеспособность партизан и результативность проводимых боевых операций; обеспечение личной безопасности руководства партизанских формирований; участие в мероприятиях по дезинформации противника; разложение изменнических формирований; ликвидация лжепартизанских отрядов; выявление лиц, компрометировавших партизанское движение; выполнение специальных заданий Центра.
Боевые операции органов государственной безопасности СССР в тылу противника, в том числе и физическое уничтожение высших нацистских сановников и предателей Родины, являлись важным направлением борьбы с гитлеровскими оккупантами в годы Великой Отечественной войны. Каждый совершенный акт возмездия имел широкий общественный резонанс, утверждал неминуемость наказания нацистских преступников, волю советского народа к победе, его силу духа, которую не смогли сломить самые жестокие карательные акции оккупантов.
Некоторые вопросы организации сопротивления на оккупированной советской территории в годы Великой Отечественной войны продолжительное время оставались малоизученными. Это было обусловлено рядом обстоятельств: во-первых, засекреченностью большого количества источников по изучаемой проблеме; во-вторых, господством определенных идеологических установок в историографии советского периода (например, не принято было упоминать участие советских спецслужб в борьбе на оккупированной территории, проблему коллаборационизма и пр.). Все это не позволяло исследователям объективно и полно раскрыть тему сопротивления гитлеровским захватчикам на оккупированной ими территории.