Цианобактерии проникают внутрь подвижной одноклеточной водоросли эвглены (Euglena gracilis), ресничной инфузории парамеции (Paramecium bursaria), в эпителиальные клетки задней кишки личинок некоторых видов стрекоз, поселяются в эпидермальных клетках ресничного червя конволюта (Convoluta roscoffensis) и т. д.
В ряде случаев между симбионтами складываются настолько тесные и взаимозависимые отношения, что по одиночке они жить уже не могут. Очевидно, они необратимо утрачивают способность самостоятельно вырабатывать целый ряд веществ, которые в готовом виде поступают от живущих с ними водорослей. Так, гидра отказывается жить самостоятельно, поскольку мальтозу (иначе солодовый сахар), которой гидра питается, она получает в нужном количестве именно из клетки «своей» зелёной водоросли.