Досталось и запорожским казакам. Дело в том охранных функциях запорожских казаков государство стало нуждаться всё меньше: ведь в 1772 году после первого раздела пришла в упадок Речь Посполитая, а после Русско-турецкой войны 1768–1774 годов перестала существовать угроза набегов крымских татар. Масла в огонь добавила Крестьянская война 1773–1775 годов под предводительством Емельяна Пугачёва, в которой участвовала часть запорожских казаков. Екатерина II совершенно не желала повторения этих событий. Решить судьбу запорожских казаков было поручено фавориту императрицы – князю Григорию Потёмкину-Таврическому. 5 июня 1775 года по приказу князя войска генерала Текели ночью окружили Сечь. Казаков застали врасплох. Казаки сбежали на Дунай и в Крым. Земли запорожцев раздали.
На этом история казаков с Запорожья не закончилась. Потемкин хорошо осознавал и их ценные качества, со многими функциями казаков регулярные войска не справлялись. В 1787 году, во время путешествия Екатерины II по Новороссии казачьи старшины при участии Григория Потёмкина подали в Кременчуге в адрес императрицы прошение, в котором выразили желание по-прежнему служить. До этого Потемкин уже поручил казакам собирать добровольцев и сформировать из них тысячный полк. Полк Сидора Билого как раз и нес при Екатерине почетный караул, и он получил возможность лично вручить императрице свое прошение о восстановлении на пограничье хотя бы части древних казачьих прав. Екатерина, в ожидании очередной войны с Турцией, согласилась и казаки вернули себе все видимые атрибуты бывшей Сечевой вольницы: знамена, печати, булаву кошевого атамана, перначи, деление войска на курени, которые назывались точно так же как на Сечи. Отныне они начали называться "Верным войском Запорожским", которое вскоре стало именоваться Черноморским За активные действия на черноморском побережья. Активное участие черноморцев в новой войне вернуло им благосклонность русского правительства. Итак, в 1787 г. было учреждено Кош Верных Казаков из бывших запорожцев. Изначально в нем было 600 человек. Но набирали сечевиков, рассеявшихся по Украине.
Возвращались некоторые эмигранты, не желая воевать против своих братьев-казаков. Кошевым был назначен Сидор Иванович Белый. Который имел чин секунд-майора. Он же возглавил пешую команду, конную – Захарий Чепига, флотилию – войсковой судья Антон Головатый. Потемкин же стал «верховным гетманом» Казачьих Войск Юга Украины. Стоит отметить небезынтересный факт, что по запорожским законам их предводители сами должны были быть казаками, то есть принадлежать к какому-то куреню. И Потемкина символически приняли в Кущевский курень. В 1788-1791 гг. черноморцы приняли активное участие в боях с турками при Хаджибее, Бендерах, в штурме Очакова и Измаила.