Благодаря настойчивости молодого доктора началось строительство новой лечебницы, проект которой возглавил городской архитектор А. Я. Буткин. Место было выбрано в центре, в районе современной улицы Тоннельная под горой Батарейка. Над этим местом впоследствии была сделана выемка грунта для строительства железнодорожного тоннеля, и больница разрушилась в 1910 году в результате оползня. Таким образом, больница проработала недолго, с 1902 по 1910 г. В отличие от прежней амбулатории, она была уже на 30 мест, и в ней были операционный блок, инфекционный изолятор и прозекторская. Строительство первой городской больницы в Сочи позволило наладить медицинскую, особенно оперативную, помощь населению, а перед Аркадием Львовичем открылись новые профессиональные горизонты, но, к сожалению, всё изменил 1905 год.
Hoc erat in fatis (Это было предначертано судьбой)
Являясь человеком неравнодушным и энергичным, Гордон имел свои политические убеждения. По мнению его родственников, он был «левых убеждений». Не чужды ему были идеи Маркса. В материалах предварительного следствия А.Л. Гордону вменяли председательство в комиссии по выработке инструкции милиции, председательство в народном суде, участие в обезоруживании стражи, побуждении народа к свержению самодержавия. После поражения сочинского вооруженного восстания Аркадий Львович был арестован и помещен в тюрьму. Его освобождению во многом способствовала его будущая супруга Мария Яковлевна Гордон (до замужества Акимова-Перетц), имевшая на тот момент сына от первого брака, впоследствии усыновлённого А.Л. Гордоном, Кирилла Аркадьевича – продолжателя семейных традиций. Должность городского врача Аркадий Львович занимал до 1905 года; впоследствии ему было запрещено занимать государственные должности за участие в Сочинском восстании 1905-1906 годов.
В период от восстания 1905 до революции 1917 года Аркадий Львович продолжил свою профессиональную деятельность в виде частной медицинской практики, хотя и существенно ограниченную наложенными судебными запретами. После освобождения ему запретили занимать какие-либо государственные должности, в том числе должность городского врача. Отогревшись после заключения в созданном семейном уютном гнезде, где он нашел любовь и душевную заботу Марии Яковлевны, подарившей ему в 1907 году их первого совместного сына Льва, а в 1910 году – дочь Елизавету, А. Л. Гордон за три года частной практики смог восстановить свою репутацию одного из лучших врачей города.