Эпоха Токугавы закончилась гражданской войной, в результате которой сёгун был свергнут, а император вновь обрел полную власть. Якудза не теряли времени и, воспользовавшись смутой в стране, стали самостоятельной силой: начали предоставлять своих бойцов либо сёгуну, либо императору. Выбранная тактика не очень удачно отразилась на якудза – император стал преследовать их после обретения власти, – но последующие Японо-китайская и Русско-японская войны позволили якудза воспользоваться экономическим кризисом, который стал прекрасной средой для процветания криминала. Государство, осознавая, что существование якудза является неотъемлемой частью поддержки правительства, относилось к их деятельности очень терпеливо. В то время социалистические и левые организации плохо сочетались с политикой властей, и именно якудза помогали правительству подавлять митинги рабочих и профсоюзов. Такой принцип сосуществования преступности и государства соблюдался вплоть до окончания Второй мировой войны. После окончания военных действий ставку на якудза начали делать не только местные правые политики, но и оккупационные американские силы, поскольку ультраправые якудза были идеальным оружием против социалистов. Более того, экономике послевоенной Японии пришлось пройти долгий путь восстановления, и все вновь возникшие рынки якудза недолго думая подмяли под себя, и масштабы теперь уже черного рынка стали просто невообразимы.
В начале XX века якудза начали расширять свое влияние посредством проституции и продажи запрещенных веществ, ажиотаж на которые был вызван потребностями как японской, так и уже американской армии.
В 50-е годы из-за стремительного роста группировок якудза Япония превратилась в их поле боя, а в 60-х годах, когда американцы ушли из страны, а сама Япония вступила в ООН, с якудза наконец начали бороться и даже сократили их число вдвое.
Как часто вы нечаянно попадали в общество проституток или замечали, как у случайного прохожего выпадал «белый порошок» из кармана? Как часто покупали еду у членов криминальной организации, пока ваши дети играли с ними в тире?
Однако в то же время якудза стали популярными персонажами кинематографа, а молодежь, наблюдая за примером с большого экрана, начала объединяться в банды «гопников», копировавших поведение якудза. Эта мода привела к тому, что количество бандитов стало снова расти, а образ группировок все еще был необходим правительству.