Важным аспектом деятельности Макарова было развитие трального флота. Он понимал, что для эффективной борьбы с минами необходимо иметь средства для их обнаружения и уничтожения. Он разрабатывал новые типы тралов – как контактные, так и неконтактные – и обучал личный состав тральных команд эффективным методам траления. Его работы в этой области позволили снизить потери от мин во время русско-японской войны.
Макаров также уделял большое внимание развитию торпедного оружия. Он разрабатывал новые типы торпед с увеличенной дальностью и скоростью, а также с более мощными боевыми частями. Он совершенствовал системы наведения торпед и разрабатывал тактику применения торпедных катеров и эсминцев.
Он предвидел будущее за торпедными катерами – небольшими, но скоростными и маневренными судами, способными наносить внезапные удары по вражеским кораблям. Макаров активно продвигал идею строительства торпедных катеров и лично участвовал в разработке их конструкции. Он организовывал обучение личного состава торпедных катеров и разрабатывал тактику их применения в различных условиях. Его ученики успешно применяли торпедные катера во время русско-японской войны.
Вклад Макарова в развитие минно-торпедного оружия был не только техническим, но и тактическим. Он разработал новые тактические приемы применения мин и торпед, которые позволили значительно повысить их боевую эффективность. Он также разработал системы взаимодействия между минными заградителями, тральщиками и торпедными катерами, что позволило им эффективно действовать в составе флота.
Макаров также уделял большое внимание развитию гидрографических исследований. Он понимал, что для успешных действий флота необходимо иметь подробные карты морского дна, информацию о течениях, глубинах и других гидрографических характеристиках акватории. Он организовывал гидрографические экспедиции, которые проводили исследования в различных районах мирового океана. Результаты этих исследований использовались для составления морских карт, лоций и других навигационных пособий.
Вклад Макарова в гидрографию был не только практическим, но и теоретическим. Он разрабатывал новые методы гидрографических исследований и совершенствовал гидрографическое оборудование. Он также организовал подготовку гидрографов и обучал их современным методам работы.