Но ведь они эволюционируют, а значит меняют структуру. Как происходит квалификация в таких случаях?
И здесь вступает в дело такое понятие, как штамм. И, задумайтесь, никто никогда не слышал о штаммах герпеса (какой именно у него), хотя они существуют. Почему о них не говорят? Потому что это лишняя информация – наш организм и так прекрасно справляется. Только в тех случаях, когда он сталкивается с серьёзной проблемой, вирус изучают досконально, определяя его штамм и те аспекты, которые представляют угрозу для здоровья.
1. Вид (species)
– Это крупная таксономическая категория в биологии.
– Вирусы простого герпеса 1 вида (HSV-1) и простого герпеса 2 вида (HSV-2) считаются разными видами, потому что у них существенные различия в геноме. Хотя оба относятся к семейству Herpesviridae, их ДНК отличается примерно на 20—30%.
2. Штамм (strain)
– Это разновидность внутри одного вида.
– Например, у HSV-1 и HSV-2 есть множество разных штаммов, отличающихся мутациями в ДНК.
Штаммы могут отличаться по:
– Вирулентности (насколько они заразны и опасны).
– Устойчивости к лекарствам.
– Иммунному ответу организма.
– Однако разные штаммы остаются в пределах одного вида – они не настолько разные, чтобы считаться новыми видами.
Значит ли это, что штаммы = новый вид? Нет. Хотя каждый штамм имеет уникальные мутации, он не отличается настолько сильно, чтобы стать отдельным видом. Для этого различия в ДНК должны быть существенными – например, как между HSV-1 и HSV-2.
Если различий менее 10%, это обычно штамм.
Если различия более 20—30% и затрагивают ключевые гены, то это новый вид.
Определить точное количество известных штаммов вируса простого герпеса (HSV-1 и HSV-2) затруднительно, поскольку эти вирусы обладают значительной генетической вариабельностью. Исследования показывают, что HSV-1 можно разделить на шесть основных кластеров (клади), четыре из которых распространены в Восточной Африке, один – в Восточной Азии, и еще один – в Европе и Северной Америке. Это свидетельствует о долгой истории эволюции и распространения вируса среди человеческих популяций.
В случае HSV-2 данные о количестве штаммов менее детальны. Однако известно, что геномы HSV-2 делятся на две основные группы: одна распространена глобально, а другая преимущественно ограничена регионом субсахарской Африки.