Развитие Аугсбурга в XI—XV вв. было связано со значительным развитием торговли, как транзитной, так и с сельской округой, а также с развитием цехового производства. Всё это вело к росту городского патрициата, всё больше претендовавшего на самостоятельность в управлении городом.
21 июня 1156 года Аугсбург получил от императора Священной Римской империи Фридриха Барбароссы (Friedrich Barbarossa) городской устав, который в 1251 году был продлён и расширен рядом прав и привилегий. 9 марта 1276 года король Рудольф фон Габсбург провозгласил Аугсбург имперским вольным городом, сделав его фактически независимой городской республикой, только формально подчинявшейся императору. Расширение автономии Аугсбурга привело к конфронтации с епископом, обладавшим ранее светской властью над городом. Противостояние городских властей и епископа завершилось перенесением главной епипской резиденции в Диллинген на Дунае.
В результате власть в Аугсбурге оказалась в руках богатых патрицианских семей, к которым относились представители высших слоёв имперского бюргерства и купеческой знати. Им принадлежала финансовая, административная и судебная власть в городе, и из них формировался Городской совет и другие учреждения города. В 1368 году в Аугсбурге произошло восстание городских ремесленников, в результате которого власть от патрициата перешла к ремесленным цехам. Они также добились введения конституции цеховых гильдий, регулировавшей всю ремесленную деятельность в городе.
В 1390 году в городе появилась первая в Германии бумажная фабрика, помимо этого также интенсивно развивалось ткацкое производство. Именно в это время из среды аугсбургских ткачей вырос торговый и банкирский род Фуггеров, оказавший сильное влияние на развитие Аугсбурга как финансового центра Европы. Начав с торговлей тканями, Фуггеры затем прибрали к свом рукам всю добычу серебра и меди в различных европейских странах, впоследствии активно занимались колонизацией Нового света. С XV века Дом Фуггеров также энергично занимался ростовщичеством и финансовыми операциями, в XVI веке они предоставляли крупные денежные кредиты Габсбургам и Папе Римскому. Благодаря Фуггерам, в 1540 году в Аугсбурге открылась одна из первых в Германии фондовых бирж. Одновременно с Фуггерами в Аугсбурге развивалась открывшаяся в 1420 году фирма Вельзеров, ставшая известной благодаря торговле хлопчатобумажными тканями и серебром. Впоследствии Вельзеры владели мануфактурами в различных странах Европы, также как и Фуггеры, финансировали различных европейских монархов.