Это же может быть отнесено и к общим случаям использования дедукции и индукции как способов построения умозаключений: их упоминание при изложении методологической базы исследования может быть опущено. Однако если исследователем целенаправленно применяется, например, гипотетико-дедуктивный метод, который является примером именно научной методологии в точном смысле слова, то это стоит оговорить и обосновать. Также, например, заслуживает упоминания и методологического обоснования использование при организации эмпирических исследований принципов (методов) научной индукции, разработанных Джоном Стюартом Миллем. «Метод единственного сходства», «метод единственного различия», «метод сопутствующих изменений», безусловно, могут являться логическим обоснованием выстраивания стратегии конкретных эмпирических исследовательских действий и обработки полученной эмпирической информации. «Метод остатков», на наш взгляд, имеет меньший потенциал для практического использования, однако в ряде случаев в качестве методологической предпосылки может быть использован и он.
Достаточно часто, назвав те логические процедуры, которые, строго говоря, научными методами в полном смысле слова быть названы не могут (анализ и синтез, абстрагирование, обобщение, сравнение, дедуктивный вывод), авторы забывают остановиться на тех теоретических научных методах, которые представляют собой именно некий алгоритм исследовательских действий и имеют достаточно проработанную технику применения. Речь может идти, например, о системном анализе, применяемом как к объекту исследования, так и к его предмету, а также и к его проблематике, о методе исторического анализа, который также может быть применён во всех этих аспектах, о методе идеализации, то есть создания теоретических конструктов, призванных выразить сущностные связи в изучаемой реальности, о методе теоретического моделирования, который примыкает к только что названному методу идеализации, о гипотетико-дедуктивном методе, который был упомянут нами выше, о герменевтическом методе, который более чем уместен, если исследование так или иначе ставит вопросы понимания и истолкования изучаемой реальности, воспринимаемой как текст в широком смысле. Повторим: применение всех этих методов требует обоснования спецификой решаемых исследовательских задач.