E-not – DeepSeek. Диалоги 3 - страница 3

{ARA=1024.3ART=976.5ARG=1008.7ARC=990.5⎩⎨⎧ARA=1024.3ART=976.5ARG=1008.7ARC=990.5

(Проверка: 1024.3+976.5+1008.7+990.5=40001024.3+976.5+1008.7+990.5=4000)

Чистый рейтинг влияния (Ri – ARi):

{A:1103.6−1024.3=+79.3T:1052.8−976.5=+76.3G:953.2−1008.7=−55.5C:890.4−990.5=−100.1⎩⎨⎧A:1103.6−1024.3=+79.3T:1052.8−976.5=+76.3G:953.2−1008.7=−55.5C:890.4−990.5=−100.1

Интерпретация:

A и T имеют положительный чистый рейтинг (сильнее).

G и C – отрицательный (слабее в данной модели).

Если нужны вычисления в матричной форме или дополнительные пояснения – спрашивайте.

Эти оценки влияния – одинаковы для всего живого мира, или есть отклонения для разных царств хотя бы?

Хороший вопрос. Оценки влияния оснований ДНК (A, T, G, C) действительно не универсальны для всего живого мира. Они могут варьироваться в зависимости от:

1. Различий в составе ДНК у разных организмов

ГЦ-содержание (доля пар G-C) сильно отличается: У бактерий – от 20% до 75%. У человека – ~42%. У термофильных организмов (например, Thermus aquaticus) – до 70% (так как G-C пары стабильнее при высоких температурах).

Вирусы могут использовать урацил (U) вместо тимина (T) в РНК, что меняет их матрицу влияния.

2. Особенностей структуры ДНК

Митохондриальная ДНК (мтДНК) у эукариот имеет иной состав и даже альтернативные кодоны (например, AGA/AGG у человека кодируют стоп-кодон в митохондриях, а в ядерной ДНК – аргинин).

Атипичные пары (например, G-U в РНК) могут влиять на стабильность.

3. Эволюционных адаптаций

Гипертермофилы (организмы, живущие при +80°C и выше) имеют повышенное содержание G-C пар для термостабильности.

Паразиты с редуцированными геномами (например, Mycoplasma) могут демонстрировать аномально высокое содержание A-T пар (до 90%).

4. Модифицированных оснований

У некоторых организмов есть редкие основания (например, 5-метилцитозин у растений и животных), которые меняют силу водородных связей.

Вывод

Предложенная матрица влияния (A-T=70, G-C=60 и т.д.) – упрощённая модель. Для конкретных групп организмов её стоит корректировать с учётом:

ГЦ-состава (чем он выше, тем сильнее влияние G-C пар).

Температурных адаптаций (термофилы → больше G-C).

Наличия атипичных пар (например, РНК-вирусы).

Если нужно построить специализированные матрицы для бактерий, архей или митохондрий – уточните, и я помогу с расчётами.