Тем временем продолжалась борьба с выступлением оренбургского казачества. Хотя 16 декабря 1917 года атаман Дутов объявил мобилизацию казаков, она шла не слишком успешно (хлебнувшие тяготы мировой войны казаки не рвались снова воевать). Впрочем, даже малочисленные казачьи отряды представляли собой реальную силу, одолеть которую было нелегко. Но все же сторонникам советской власти сопутствовал успех. Отряды под командованием Блюхера разбили казаков Дутова и 31 января заняли Оренбург. Дутов отступил в Верхнеуральск, но и он был занят в начале марта отрядами Блюхера при поддержке восстания в самом Верхнеуральске. Дутову с остатками казачьих войск пришлось отступить в Тургайскую степь.
В марте 1918 года Куйбышев был отправлен от самарских большевиков в Петроград делегатом на VII (экстренный) съезд РКП(б) (6–8 марта), имея на руках позицию губисполкома, принявшую резолюцию «левых коммунистов» с призывом к «священной войне» против германского империализма[31]. На съезде он в числе 12 делегатов голосует против предложения Ленина, призывавшего к заключению мира. Затем он едет в Москву на IV Всероссийский съезд Советов (14–16 марта) и там зачитывает с трибуны «Декларацию 63-х», которую подписали 55 делегатов и 8 членов ВЦИК. Они призывают к обороне социалистической революции, но при этом не голосуют против мира, а предпочитают воздержаться. Итог голосования: 784 голоса за мир, 261 – против, 115 – воздержавшихся.
После возвращения Куйбышева в Самару он не сразу признает правильность мирного договора с Германией. Самарская губернская парторганизация выносит резолюцию с одобрением политики Совнаркома РСФСР в вопросах войны и мира, и Куйбышев в конце концов также присоединяется к поддержке ратификации Брестского договора.
Казалось бы, вспышки Гражданской войны в Поволжье и Приуралье подавлены, на германском фронте заключен мир, и Самарскому губисполкому во главе с Куйбышевым можно приступать к мирному хозяйственному строительству. Но передышки практически не получилось. И внутреннее положение в Самарской губернии, и внешние условия не дали этой передышке состояться.
В марте 1918 года губернский съезд Советов образовал в Самарском губисполкоме меньшевистско-эсеровское большинство. В то же время в Самарском городском Совете большевики имели прочные позиции, и в результате в Самаре сложилось своеобразное двоевластие. Губисполком образовал собственную боевую дружину, опираясь на недовольные советской властью слои крестьянства. Ухудшилась и внешняя ситуация – в апреле вновь активизировались отряды казаков Дутова, а одновременно и независимо от них стало разрастаться восстание казачества в других районах, приведшее к блокаде Оренбурга и даже к кратковременному (на несколько часов) захвату города.