Существенные изменения подходов в описании истории отдельных университетов Российской империи обозначились только в постсоветский период. Эти изменения хорошо продемонстрированы в четырехтомном труде по истории Московского университета под редакцией В. В. Пономаревой и Л. Б. Хорошиловой22, отличающемся историко-культурным подходом, а также в работах Н. Я. Олесич о студенчестве Петербургского университета23, Е. А. Вишленковой, С. Ю. Малышевой, А. А. Сальниковой о мире Казанского университета24, И. П. Кулаковой об университетском пространстве Московского университета25, С. И. Посохова по истории Харьковского университета в городском пространстве26, коллективной монографии «Университет и город в России»27.
В начале XXI в. появились работы, в основу которых был положен историко-культурный подход, переплетенный с историей повседневности. Это исследования К. С. Казаковой и Т. Н. Жуковской по истории Петербургского университета28, московских историков А. Ю. Андреева29, П. В. Гришунина30, А. М. Феофанова31, Д. А. Цыганкова32, казанских историков Т. В. Костиной и Л. А. Сазоновой по истории казанской профессуры33. Рассмотрение истории Санкт-Петербургского университета в контексте социально-политической истории России было проведено Е. А. Ростовцевым34. Истории московской профессуры второй половины XIX – начала XX в. с точки зрения социокультурного подхода посвящено исследование Н. Н. Никс35.
1990‑е и начало 2000‑х гг. являют собой продолжение исследовательского интереса к теме взаимоотношения университетов и власти, к рассмотрению университетской проблематики с точки зрения внутренней политики государства, что было характерно еще для советской историографии. Заметно преобладание работ, описывающих политическую историю образования и историю образовательных реформ. К таким работам можно отнести монографии А. Е. Иванова о системе научной аттестации36, которая положила начало целому направлению, связанному с изучением ученых степеней в университетах37; монографии Е. С. Ляхович и А. С. Ревушкина, А. И. Авруса, В. А. Змеева, Ф. А. Петрова38, коллективную монографию «Очерки истории образования и научной политики в Российской империи – СССР»39. Среди работ начала XX в., посвященных этому направлению университетских штудий, можно назвать исследования образовательной политики государства