Иноческая жизнь преподобного Геннадия проходила в беспрестанных трудах. Он не отказывался ни от какой работы: колол дрова, пек просвиры, копал пруды. Под одеждой Геннадий носил тяжелые вериги, которые усиливали нагрузку на тело во время работы. Таким образом он усмирял плоть, добиваясь полного духовного совершенства. Больше всего же любил Геннадий писать святые образа, которые размещал на стенах построенных храмов. За жизнь, полную христианских подвигов и смирения, преподобный Геннадий был вознагражден Господом даром провидения и целительства.
Так, во время одного из визитов в Москву святой Геннадий предрек дочери знатного боярина предстоящее царствование. Девушке с трудом верилось в его слова, и все же вскоре предсказание сбылось: она действительно вышла замуж за царя Ивана Грозного, и их супружеский союз был на редкость удачен. Впечатленный пророческим даром преподобного, царь Иоанн попросил его согласия быть крестным отцом царственной малышки. Дар исцеления помогал Геннадию для врачевания больных, среди которых был и вологодский епископ Киприан.
Прожив долгую и насыщенную праведными трудами жизнь, преподобный Геннадий Костромской умер 23 января 1565 года. Сто лет спустя были обретены нетленными его святые мощи, которые торжественно перенесли в Преображенский храм Геннадиева монастыря.
Избранниче Божий и чудотворче, преподобне отче Геннадие! От юности твоея исполнен сый духа премудрости и разума, духа благочестия и страха Господня, и приим вся оружия Божия, препоясав чресла твоя истинною, оболкся в броню правды и обув нозе во уготование благовествования мира, над всеми же восприим щит веры, возмогл еси, яко добрый воин Христов, вся стрелы лукаваго разжженныя угасити. Сего ради, водворяяся днесь, с ликами безплотных сил, в обителех Отца Небеснаго, неувядаемым венцем увязен еси: и предстоя престолу Царя славы Господа сил, имаши дерзновение возносити к Нему моления и благохваления твоя. Мы же окаяннии, возводяще из глубины зол очи и сердца наша к горнему Сиону, жилищу Бога Иаковля, молим тя, преподобне Геннадие: буди заступником и ходатаем нашим пред Богом и Господем нашим, Судиею праведнейшим, Его же выну прогневляем, согрешающе пред Ним. И яко же во дни плоти своея дивная и преславная совершил еси, отче всехвальне, тако и ныне, прешед от нас в обители Отца Небеснаго, удиви ходатайством своим милость Господню на нас. Да, отбегше нечестия и мирских похотей, Богови же благоугодивше, обрящем помощь Его во время благопотребно, и благословение на ны и на дела рук наших, и да сподобит нас наследити Царство Небесное и с лики святых славити и воспевати пречестное и великолепое имя Отца и Сына и Святаго Духа, ныне и присно и во веки веков. Аминь.