Однако следует отметить, что эти еще не окрепшие коллективные хозяйства с честью выполнили свой долг перед Родиной в годы Великой Отечественной войны. В условиях плановой экономики работать Даниялову А.Д. было крайне трудно. Планы развития сельского хозяйства утверждались сверху, из Москвы, и делалось это не редко без учета местной специфики. Так было, например, с культивированием хлопка в республике.
Усилия Даниялова объяснить вышестоящим инстанциям нецелесообразность культивирования хлопка в Дагестане заканчивались упреками в адрес руководства наркома. Ему даже пытались объявить партвзыскания.
Еще не успел Даниялов как следует освоить должность наркомзема, как летом 1937 года приехал уполномоченный Северо-Кавказского крайкома, куда входил Дагестан, и составил справку о неудовлетворительном состоянии с прополкой хлопка и предложил проект объявить Даниялову выговор, но бюро обкома не поддержало.
В конце концов, руководству республики удалось убедить Наркомзем и Госплан СССР в нецелесообразности посева хлопка в Дагестане. Тогда в республике хлопок сеяли на 2–3 тыс. га и получали крайне низкий урожай 1,5–3 ц. с гектара.
По инициативе А.Д. Даниялова в республике на прикупленных землях начали сев зерновых, строительство животноводческих помещений и социально-бытовых объектов для животноводов.
А для борьбы с малярией, которая уносила жизни сотни и тысяч дагестанцев, на этих землях были организованы 20 противомалярийных станций, в которых работали сотни врачей и медработников. После ликвидации очагов малярии колхозы горных районов начали интенсивное освоение зимних пастбищ.
Несомненно, что во всех успехах и недостатках сельского хозяйства республики имеется заслуга и Наркомзема, и руководителя Даниялова А.Д.
На посту наркомзема он в течение трех лет свою теоретическую подготовку сочетал с навыками руководства основной отраслью экономики республики, и он оказался подготовленным, чтобы ему доверяли более ответственный участок работы.
По непонятным причинам в начале 1940 года между первым секретарем Линкуном и Председателем СНК Магомедовым сложились ненормальные отношения, которые закончились освобождением второго.
И 21 января 1940 года последовало постановление ЦКВ-КП (б) об освобождении Д. М. Магомедова от обязанностей Председателя СНК с оставлением его в распоряжении обкома, и в этой должности был утвержден А.Д. Даниялов.