Изотопы, как обычный водород, тяжелый и сверхтяжелый тоже можно считать уровнями структурной организации материи, но надо иметь в виду, что эти уровни находятся внутри одного химического элемента – атома водорода, то есть изотопы являются подуровнями структурной организации водорода. Другие химические элементы, отличающихся количеством заряда, являются уровнями структурной организации химических элементов, дающие большое разнообразие свойств химических элементов и их соединений.
При рассмотрении атомов, как уровней структурной организации материи, четко прослеживаются законы диалектики: переход от простого к сложному, переход количественных изменений в качественные (при добавлении нейтрона получается новый химический элемент – изотоп того же элемента, с другими свойствами, более высшего уровня; при добавлении протона, появляется другой элемент таблицы Менделеева).
В термоядерных реакциях на Солнце происходит образование нового химического элемента гелия, из 4-х ядер водорода образуется одно ядро гелия, с атомным весом 4, с научным названием Helium (Не), который был открыт в 1868 г. при исследовании спектроскопом солнечных выступов (протуберанцев) при полном солнечном затмении, потому название получил, как "солнечное вещество" от греческого слова "гелиос" – Солнце. В 1895 г. гелий был открыт на Земле в некоторых минералах, а затем в воде и воздухе. Гелий – нейтральный газ, не вступает ни в какие реакции, прозрачный, без запаха и вкуса, имеет самую низкую температуру кипения -269°C, замерзает при – 272°C. (на один градус выше температуры абсолютного нуля).
Следующим химическим элементом в периодической системе является Литий – Lithium (Li), от греческого слова "литос", что значит камень, открытый в 1817 г. Атомный номер химического элемента 3, с атомной массой 6,941. Литий самый легкий щелочной металл, серебристо белого цвета, в 5 раз легче алюминия.
И т. д. каждый последующий атом системы Д. И. Менделеева является следующим уровнем структурной организации материи внутри атомной ветви структурной организации со своими ветвями уровней структурной организации атомов – изотопов. Некоторые атомы были предсказаны благодаря открытой систематизации их в таблице Д. И. Менделеева, некоторые получены искусственным путем и не изучены их свойства.