Особый интерес вызывает именно советский период становления механизма управления развитием региона. Условно его можно разделить на три этапа: дореформенный период, период трансформации экономики и выделения Калининградской области в регион с особым статусом.
В дореформенный период (до 1991 г.) уровень развития области был не очень высок, а народное хозяйство, представленное узкоспециализированными и мало связанными друг с другом отраслями, не составляло единого комплекса. Несмотря на очевидные выгоды экономико-географического положения Калининградской области (незамерзающий выход к морю, соседство с развитыми регионами страны и со странами СЭВ), благоприятные природные предпосылки, развитую инфраструктуру и высокую плотность населения, регион и до начала 1990-х годов имел лишь средний для Российской Федерации уровень социально-экономического развития.
На этапе структурной трансформации экономики (1992—1998 гг.) спад производства в промышленности и сельском хозяйстве региона, на транспорте и в строительстве оказался более глубоким, чем в среднем по стране. Дополнительным фактором стало то, что после распада Советского Союза прежняя отраслевая структура экономики области вследствие ее пространственной отдаленности от основной территории страны и ресурсной базы перестала работать.
В 1996 г. был принят Федеральный закон «Об Особой экономической зоне в Калининградской области», а до этого, с 1991 г., в области действовало принятое Правительством РФ «Положение о свободной экономической зоне „Янтарь“». Смысл создания СЭЗ состоял в формировании в области специального компенсационного механизма свободной таможенной зоны для стимулирования развития экспортных и импортозамещающих производств. Однако введенный в регионе режим ОЭЗ был нестабилен, входил в противоречие с федеральными законами, в связи с чем, ожидавшегося притока иностранных инвестиций в область не произошло. Более того, на начальных этапах введения режима ОЭЗ вследствие резкого снижения таможенных пошлин местное производство из-за конкуренции импорта сокращалось, а затем вовсе остановилось, оставив только ресурсодобывающие компании.
Поскольку сегодня чаще всего под механизмом управления в научных кругах понимается механизм ОЭЗ в Калининградской области, чтобы провести анализ систем управления экономикой Калининградской области мы обязаны проанализировать теоретические разработки, касающиеся ОЭЗ в мире и результаты их использования для развития Калининградского региона.