Критерием разграничения компетенции ВАС РФ и арбитражных судов субъектов РФ и является родовая подсудность, однако род дела при этом предопределяется составом субъектов спора. Такой вывод следует из того, что, например, дела о признании недействительными ненормативных и нормативных актов, изданных другими государственными органами, кроме названных в ч. 2 ст. 34 АПК РФ, не рассматриваются ВАС РФ.
Исходя из правил родовой подсудности можно также заключить, что никакие дела не рассматриваются по первой инстанции федеральными арбитражными судами округов, которые также входят в систему арбитражных судов в РФ и являются ее новым звеном (ст. 3 ФКЗ «Об арбитражных судах в РФ). Их назначение – проверка в кассационном порядке судебных актов, принятых арбитражными судами субъектов РФ. В частности, в ст. 24 ФКЗ „Об арбитражных судах в РФ“ определено, что федеральные арбитражные суды округов являются судами по проверке в кассационной инстанции законности решений арбитражных судов субъектов РФ, принятых ими в первой и апелляционной инстанциях.
В ч. 2 ст. 34 АПК РФ прямо названы категории дел, которые ВАС РФ рассматривает по первой инстанции. Причем круг этих дел очень ограничен. Законодатель относит к родовой подсудности ВАС РФ лишь три категории дел:
1) дела об оспаривании нормативных правовых актов Президента РФ, Правительства РФ, федеральных органов исполнительной власти, затрагивающих права и законные интересы заявителя в сфере предпринимательской и ивой экономической деятельности;
2) дела об оспаривании ненормативных правовых актов Президента РФ, Совета Федерации и Государственной Думы Федерального Собрания РФ; Правительства РФ, не соответствующих закону и затрагивающих права и законные интересы заявителя в сфере предпринимательской и иной экономической деятельности;
3) экономические споры между Российской Федерацией и субъектами РФ, между субъектами РФ.
Это означает, что все другие подведомственные арбитражным судам дела, независимо от того, касаются ли они имущества, относящегося к федеральной собственности, собственности субъектов РФ, муниципальных образований, рассматриваются арбитражными судами субъектов РФ. То же самое относится и к спорам о признании недействительными ненормативных актов государственных и иных органов. Ранее такие акты, изданные государственными и иными органами РФ, обжаловались в ВАС РФ. В соответствии с действующим АПК РФ круг органов, ненормативные акты которых могут быть обжалованы в ВАС РФ, ограничен актами высших органов государственной власти РФ. Ненормативные акты других государственных органов, в том числе федеральных министерств и ведомств, обжалуются в арбитражном суде субъекта РФ по общим правилам территориальной подсудности. При этом следует иметь в виду, что если в одном иске заявлено несколько требований, адресованных различным ответчикам, например, о признании недействительными ненормативных актов, изданных Правительством РФ, федеральным министерством, органом исполнительной власти субъекта РФ, то эти требования необходимо разъединить и рассматривать с учетом правил подсудности. Так, иск о признании недействительным ненормативного акта Правительства РФ будет рассматриваться ВАС РФ согласно ст. 34 АПК РФ, а в части других требований судья должен возвратить исковое заявление со ссылкой на ч. 1 ст. 34 АПК РФ.