К основным видам налогов относятся: налог на добавленную стоимость, единый социальный налог (с 01.01.2010 г. страховые взносы), налог на прибыль, единый сельскохозяйственный и земельный налоги, налог на доходы физических лиц и др.
В российском налоговом законодательстве для сельхозтоваропроизводителей предусмотрена возможность выбора системы налогообложения: это либо применение общей системы налогообложения, либо использование специальных налоговых режимов, к которым относятся: единый сельскохозяйственный налог (ЕСХН), упрощённая система налогообложения (УСН) и единый налог на вменённый доход для отдельных видов деятельности (ЕНВД). Выбор системы налогообложения должен быть всесторонне проанализирован и взвешен, т.к. от этого будет зависеть в определенной степени результат всей хозяйственной деятельности. Однако, возможность применения упрощенной системы налогообложения и единого сельхозналога предоставляется при соблюдении условий, оговоренных в налоговом законодательстве. Так, например, для применения УСН необходимо, чтобы за девять месяцев предыдущего года доходы с учетом инфляции не превышали 60 млн. руб., а для единого сельхозналога – требуется, чтобы по итогам работы за год доля дохода в общем доходе от реализации, произведенной сельхозпродукции и (или) рыбы (включая продукцию первичной переработки) была не менее 70 процентов.
Применение ЕНВД обязательно по определенным видам деятельности, например, оказание бытовых и ветеринарных услуг, услуг по ремонту автотранспортных средств, розничная торговля и др. [3].
Выбор общей системы налогообложения предусматривает уплату всех необходимых налогов, сборов и платежей, таких как налог на прибыль; налог на добавленную стоимость (НДС);
государственные пошлины; акцизы; таможенные пошлины; налог на добычу полезных ископаемых; водный налог; сборы за пользование объектами животного мира и пользование объектами водных биологических ресурсов; транспортный налог; земельный налог; налог на имущество; налог на доходы физических лиц (выступает в виде агента, т.е. исчисляет и перечисляет в бюджет сумму удержанного налога); страховые взносы (до 01.01.2010 г. единый социальный налог). Важной отличительной особенностью общей системы налогообложения сельхозтоваропроизводителей является наличие льгот по различным налоговым платежам, которые выражаются, прежде всего, в пониженных налоговых ставках по НДС, страховым взносам (до 01.01.2010 г. – ЕСН ), налогу на прибыль, земельному налогу, транспортному налогу и др. Законодательством субъекта РФ и органами местного самоуправления могут быть установлены более низкие налоговые ставки по налогу на имущество и земельному налогу.