Невнятно спозиционировались относительно ареста Ходорковского и коммунисты. С одной стороны, критика олигархов из уст членов КПРФ звучала вполне логично, но, с другой стороны, они были связаны рядом неформальных обязательств с ЮКОСом. Кандидаты в депутаты Госдумы шли не только по спискам правых партий, но и по спискам КПРФ. Так, 13-е место в федеральном избирательном списке компартии занимал бывший менеджер ЮКОСа Алексей Кандауров (в результате он прошел в Госдуму по списку КПРФ). Потому коммунисты, в отличие от «Родины», не смогли толком воспользоваться антиолигархической кампанией.
Выборы в Государственную думу закончились триумфом «Единой России» – впервые партия власти одержала уверенную победу на выборах по партийным спискам. ЕР получила 37,5% голосов (более 22 миллионов). Это позволило «Единой России» получить 120 мандатов по партийным спискам. Еще 103 места партия получила за счет победы в одномандатных округах. Стало ясно, что для формирования большинства в Госдуме «Единой России» не нужна коалиция с оппозиционными или формально провластными партиями. К тому же администрация президента и «Единая Россия» вели работу с представителями иных партий и самовыдвиженцами. В результате одномандатники из Народной партии, самовыдвиженцы и прорвавшиеся по одномандатным округам члены иных партий (яблочник Михаил Емельянов, коммунист Игорь Игошин, все три депутата от СПС, два агрария и два перебежчика из «Родины») в течение всего декабря активно подавали заявления о вступлении во фракцию «Единой России». «Единой России» удалось сформировать фракцию в 306 депутатов уже в январе 2004 года.
Существенно хуже выступили коммунисты: они набрали лишь 12,6% и получили 40 мандатов по партийным спискам. Провал ждал коммунистов и по одномандатным округам, где они смогли завоевать только 12 мест. По партийным спискам удачно выступила занявшая третье место ЛДПР – ей было отдано 11,5% голосов избирателей, что дало партии Жириновского 36 мест в парламенте[83].
Новички из «Родины» получили 9% голосов и 29 мест по партспискам, по одномандатным округам прорвались еще 8 фронтменов от «Родины»: Иван Харченко (Краснодарский край), Сергей Шишкарев (Краснодарский край), Дмитрий Рогозин (Воронежская область), Виталий Южилин (Ленинградская область), Сергей Глазьев (Московская область), Юрий Сентюрин (Нижегородская область), Дмитрий Савельев (Тульская область), Анатолий Грешневиков (Ярославская область). Однако сразу после выборов между лидерами блока начались серьезные трения.