Следует отметить, что ст. 37 УПК ранее предоставляла прокурору более широкие возможности контролировать расследование. С принятием Федерального закона от 05.06.2007 № 87-ФЗ ситуация значительно изменилась. Данным Законом полномочия по руководству расследованием и надзору за исполнением законов органами предварительного следствия были разделены между двумя субъектами – руководителем следственного органа и прокурором.
Вопрос о необходимости размежевания этих полномочий обсуждался давно, он имеет как своих сторонников, так и противников, но единого подхода к его разрешению пока не выработано. Руководство расследованием в теории рассматривалось как метод, способ надзора за его законностью[См.: Цапаева, Т. Ю. Участие прокурора в доказывании на предварительном следствии / Т. Ю. Цапаева. – Самара : Самарский университет, 2004. – С. 31; Савицкий, В. М. Указ. соч. – С. 45.], или наоборот: надзор за соблюдением следователем закона – как способ, с помощью которого прокурор направляет следствие в нужное русло, т.е. руководит им[См.: Лазарева, В. А. Судебная власть и ее реализация в уголовном процессе / В. А. Лазарева. – Самара : Самарский университет, 1999. – С. 25, 26.]. Высказывались опасения, что изъятие у прокурора значительной части полномочий ослабит прокурорский надзор и отрицательно скажется на качестве следствия и, как писал А. М. Ларин, превратит прокурора «в безвластного ходока по инстанциям»[См.: Ларин, А. М. Расследование по уголовному делу: процессуальные функции / А. М. Ларин. – М. : Юрид. лит, 1968. – С. 131.].
В качестве аргумента «против» совмещения надзора и руководства расследованием в руках прокурора указывалось на необходимость обеспечить объективность прокурорского надзора, а также устранить подмену прокурором руководителя следственного органа (ранее, начальника следственного отдела)[См.: Токарева, М. Е. Современные проблемы законности и прокурорский надзор в досудебных стадиях уголовного процесса / М. Е. Токарева. – М., 1997. – С. 14, 71; Стремовский, В. А. Участники предварительного следствия в советском уголовном процессе / В. А. Стремовский. – Ростов, 1966. – С. 71, 72.].
Первоначально российский законодатель, создавая новый УПК, воспринял идею совмещения рассматриваемых процессуальных функций. Статья 37 УПК давала прокурору возможность контролировать каждый шаг органа расследования – от приема и регистрации сообщения о преступлении до принятия итогового решения (о направлении уголовного дела в суд или о прекращении уголовного дела и уголовного преследования). Без его одобрения следователь не мог ни возбудить уголовное дело, ни совершить сколь-нибудь значимые процессуальные действия. Письменные и устные указания прокурора по любому вопросу были обязательны для следователя, прокурор мог отменить незаконное постановление, отстранить следователя от производства расследования и т.п.