Репертуар деятельности крупных сетевых водоохранные экоНПО более сложен, и они больше заняты задачей координации деятельности небольших водоохранных экоНПО. Вместе с тем, все водоохранные экоНПО, так или иначе, в описании своей деятельности указывают случаи привлечения внимания местного населения и администрации к проблемам «их подопечного» водного объекта.
Практически все изученные водоохранные экоНПО не имеют постоянного финансирования, большинство из них периодически получают финансирование в виде грантов из экологических отечественных и иностранных фондов. Сетевые водоохранные экоНПО более успешны в получении финансирования и различных ресурсов, они становятся ресурсно-информационными центрами и перераспределяют свои ресурсы в сеть небольших водоохранных экоНПО и экологических групп. Некоторые водоохранные экоНПО имели постоянное финансирование, но оно исчезло после начала реструктуризации государственных природоохранных структур в 2000 году.
Тема финансирования водоохранных экоНПО и его количество является приватной. Обычно информанты охотнее рассказывают о количестве финансирования и ресурсов у других водоохранных экоНПО. Давая информацию о своём водоохранном экоНПО, принято занижать количество финансирования и стараться не называть его источники.
Если почти все водоохранные экоНПО имеют контакт и пытаются более или менее успешно сотрудничать с местными администрациями, то с промышленными и торговыми предприятиями сотрудничают единицы. Они не только получают гранты, но и зарабатывают деньги, заключая хозяйственные договора на экспертные работы по оценке воздействия на окружающую среду промышленных предприятий.
Можно отметить, что водоохранные экоНПО, выполняющие координационные функции по проектам и имеющие сетевую структуру, а также крупные водоохранные экоНПО на базе районных или городских государственных учреждений дополнительного образования чаще получают гранты из иностранных фондов, чем водоохранные экоНПО, действующие на базе сельских и пригородных средних школ. Но последние чаще получают финансовую или другую материальную поддержку от местных администраций.
У всех исследованных водоохранных экоНПО большие сложности с привлечением финансовых ресурсов. В своей работе водоохранные экоНПО, в основном, привлекают местные материальные и человеческие ресурсы. Это происходит часто по месту работы лидеров. Благодаря их персональным связям, вовлекаются добровольцы, используются помещения и оборудование тех учебных заведений и научных учреждений, где они работают.