Кожа птиц состоит из трех слоев: дермы, эпидермиса и подкожного слоя. Эпидермис у пернатых образует перья и роговые покровы лап, когтей и клюва. Перья предохраняют тело птиц от повреждений и обеспечивают постоянную температуру тела. По своему строению, назначению и форме перья подразделяются на пуховые, контурные, кисточковые, нитевидные и щетинковые. Контурные перья, покрывающие всю поверхность тела птицы, делятся на кроющие, маховые и рулевые. Пуховые перья, основное назначение которых – сохранение нормальной температуры тела (42 °C), находятся под кроющими и расположены в основном на нижней стороне тела пернатых.
Маховые перья располагаются у птиц на крыльях, рулевые – на хвосте. Нитевидные перья состоят из слаборазвитого опахала и мягкого волосовидного стволика, а щетинковые – из тонкого стволика без опахала. Щетинковые перья находятся у основания клюва и над глазами (реснички).
Птицы размельчают пищу с помощью клюва и языка, после чего она продвигается по пищеводу. В нижнем конце пищевод имеет расширение (зоб), где пища под воздействием соков, выделяемых слизистой оболочкой зоба, немного размягчается и поступает в желудок. Из железистого желудка пища, перемешанная с желудочным соком, продвигается в мышечный желудок, где и происходит ее переваривание.
Из желудка переваренная пища поступает в кишечник. Конец прямой кишки, которая служит у птиц для скопления непереваренных остатков пищи, переходит в клоаку.
В полости тела пернатых находятся воздушные мешочки, которые соединяются с легкими и с полостями пустотелых и губчатых костей. Эта сложная система позволяет птицам осуществлять так называемое двойное дыхание, механизм которого пока еще не достаточно изучен. Известно, что при двойном дыхании кровь в легких окисляется все время – при вдохе и при выдохе.
Количество крови, объем кровеносных сосудов и сердце, которое состоит из двух предсердий и двух желудочков, у птиц больше (в соотношении с телом), чем у других позвоночных животных.
Количество сердечных сокращений у пернатых достигает 1000 ударов в минуту.
Почки расположены вплотную к крестцовому отделу позвоночника. Мочевой пузырь у пернатых отсутствует; мочеточники соединены непосредственно с клоакой. Моча частично всасывается стенками клоаки, а частично выбрасывается вместе с пометом.