Процессуальные противоречия: между педагогически целесообразным проектированием подготовки специалистов в вузе и подготовленностью к его осуществлению педагогов-разработчиков; между существующими способами и методами формирования содержания обучения и реальным наличием у разработчиков умений их применить; между необходимостью комплексного и коллективного планирования учебного процесса в вузе и преимущественно индивидуальным характером деятельности разработчика при его проектировании; между большими затратами времени и интеллектуального труда разработчиков процесса подготовки специалистов в вузе и недостаточным учетом этих затрат руководством вуза и кафедр.
Технологические противоречия: между необходимостью соблюдения логики спроектированного учебного плана и нарушением ее в угоду субъективным интересам факультетов и кафедр; между необходимостью сохранения логики учебной дисциплины при построении и нарушением ее в действующих программах и тематических планах; между распределением содержания обучения по многим дисциплинам и их системным, комплексным использованием в профессиональной деятельности специалиста; между необходимостью создания общей технологии подготовки специалистов в вузе и преимущественной организацией обучения студентов в рамках отдельно взятой учебной дисциплины и др.
Выявленные противоречия в процессе проектирования подготовки специалистов в вузе выступают в едином комплексе и предстают перед участниками деятельности по проектированию и организации педагогического процесса в виде различного рода трудностей и проблем. Преодолевая трудности, решая проблемы, субъекты педагогического процесса в вузе принимают определенные меры для повышения его эффективности.
Повышение роли образования в жизни общества, необходимости повышения качества подготовки студентов в высшей школе обусловило усиление внимания ученых к проблемам совершенствования подготовки специалистов в высшей школе на основе проектирования. Особое место в решении проблемы дидактического проектирования в вузах занимают исследования, посвященные механизмам проектирования подготовки специалистов в высшей школе. Наиболее значимыми являются работы: А.П. В.И. Байденко, И.А. Зимняя, И.А Колесниковой, Н.В. Кузьминой, Е.В. Лобанова, Г.Е. Муравьевой, В.В. Серикова, В.А. Сластенина, В.М. Соколова, Е.И. Трофимова и др.