Не выкапывают луковицы в дождливую погоду или сразу после полива, так как при хранении такие корнеплоды быстро испортятся. Луковицы выкапывают с помощью лопаты или подкапывают вилами, стараясь не нанести им повреждений, вытаскивают из земли и аккуратно, не кидая и не ударяя об землю и друг друга, складывают рядом с грядкой в небольшие кучи. Если травмировать или помять поверхность луковиц во время выкапывания, они будут хуже храниться.
После сбора лук не сразу отправляют в погреб, а подсушивают на солнце или в сухих, хорошо проветриваемых помещениях, разложив корнеплоды в один слой. Подсушивание необходимо проводить в общей сложности в течение одной-двух недель в зависимости от температурного режима это увеличивает лежкость. В дождливую погоду не следует оставлять лук для просушки на свежем воздухе без какого-либо укрытия, а также класть его на влажную почву. Лук можно разместить под навесом или прикрыть рогожей, соломой. Хорошо сохнет лук, подвешенный в вязках под потолком дома или в духовом шкафу. В духовке подсушивают небольшие партии луковиц, нагревая ее до минимальной температуры и периодически выключая и снова включая. Процедуру проводят в течение нескольких часов, следя, чтобы верхние чешуйки хорошо подсохли, но не растрескались.
Только после просушивания ботву и корни срезают с помощью секатора или садовых ножниц, очищают луковицы от земли, загнивших и растрескавшихся верхних чешуек, затем сортируют. Срезая ботву, оставляют сухие шейки длиной около 5 см, а во время срезки корней стараются не повредить донце луковицы. После очистки лука от ботвы, корневищ и постороннего мусора его еще некоторое время досушивают на улице или дома, время от времени вороша луковицы. При этом хорошо высушенный лук издает характерный шелест.
Сроки выкапывания чеснока зависят от сорта и назначения данной культуры. Озимый чеснок характеризуется меньшей лежкостью по сравнению с яровым, так как у него плохо развит защитный слой. Важно не пропустить момент съемной зрелости чеснока, так как при перезревании головки распадаются на зубчики прямо в почве. Такой чеснок уже нельзя хранить. Сильно перезревший корнеплод не годится для употребления в пищу.
В конце июля следует обратить внимание на состояние листьев и стрелок растения. У зрелого озимого чеснока листва желтеет и пригибается к земле. К концу августа созревает яровой чеснок. Чтобы быстрее поспели стрелкующиеся сорта чеснока, надо прищипывать цветоносы, тогда и головки будут крупнее. Стрелки также можно собирать и заготавливать, например, мариновать.