Церковь Петра и Павла
Во дворце была устроена церковь Петра и Павла (Петропавловская церковь). Длина её 20 м, ширина – 8,5 м. В этой скромной церкви венчался Пётр I c Евдокией Лопухиной.
Сад
Рядом с церковью Петра и Павла располагались висячие сады («верховые сады»). Они представляли собой сад на крыше в форме трапеции. Длина сада – 18,1 м, ширина длинной стороны – 12,78 м, короткой – 7,81 м. Площадка сада была покрыта 10 тоннами свинца, а сверху засыпана землей (растительным грунтом) толщиной в 89 см. В саду росли десятки яблонь и груш. В 1687 году посредством механизма Водовзводной башни Кремля в сад была проведена вода и устроен пруд.
Шахматная доска
В 20-м веке во время раскопок в Кремле на месте дворца Натальи Кирилловны был найден обломок гладкого белого камня с чертежом. Как потом установили археологи, это была первая находка средневековой шахматной доски.
Со второй половины 17-го века Москва «заболела» шахматами. «В так называемые шахматы, знаменитую персидскую игру, по названью и ходу своему поистине царскую, они (царские дети) играют ежедневно и очень искусно, развивая ею свой ум до удивительной степени» (Яков Рейтенфельс, «Сказания Светлейшему герцогу Тосканскому Козьме Третьему о Московии», 1676 год).
И как обнаружили современные археологи, не только царские дети, но и строители дворца играли в шахматы на гладкой плитке известняка, а затем эту «доску» пустили в кладку здания.
1679 г. – строительство дворца.
1684 г. – строительство церкви Петра и Павла.
1753 г. – дворец разобран в связи со строительством нового кремлёвского дворца.