Благодаря Министерству юстиции в 1881 году было отменено публичное исполнение смертной казни, а все законодательные предложения представлялись на его заключение перед их рассмотрением Государственным советом. В 1903 году разработан проект закона об условном осуждении. В том же году Министерством юстиции утверждены Правила о порядке содержания в тюрьмах гражданского ведомства политических арестантов. С середины 19 века, задачей Министерства юстиции становится информирование министров об утверждении уставов вновь созданных организаций, а сам министр обязан был еженедельно представлять Императору доклады о состоянии дел. В 1895 году из ведения Министерства внутренних дел в ведение Министерства юстиции было передано Главное тюремное управление.
В 1917 году Министерство юстиции было преобразовано в Народный комиссариат юстиции, начавший активное формирование судов. Следует отметить, что в очередной раз основной из главных задач в деятельности комиссариата юстиции являлось разработка и совершенствование законодательства. Принятым 1928 года постановлением центральным исполнительным комитетом народному комиссару юстиции были непосредственно подчинены в качестве заместителей прокурор и председатель Верховного Суда Республики. Согласно Положению о Народном комиссариате юстиции, утвержденному 1929 года, Верховный Суд входил в состав аппарата народного комиссариата юстиции, а уже в 1936 году прокуратура была выделена в самостоятельное ведомство. В системе Министерства создаются научно-исследовательские лаборатории и Всесоюзный институт юридических наук. Разработка и совершенствование действующего законодательства развивалось такими темпами, что уже в 1957 году в уголовном процессе закрепляется понятие презумпции невиновности, то есть правового положения, при котором лицо считается невиновным, пока не будет доказано обратное. Наркомюст получает право давать судам указания о правильности и единообразии применения судебной практики. По мнению ученого В.Е.Чиркина, с чьим мнением можно согласиться, «Правосудие – главная, но не единственная функция судебной власти. Судьи осуществляют судебный контроль за законностью и обоснованностью мер процессуального принуждения, только они разрешают применение таких мер… Пленум Верховного Суда дает судам руководящие разъяснения по вопросам судебной практики, т.е. толкует нормы права».