Корни хрена хранят при температуре +10 °C и относительной влажности не выше 80 %. Во время сушки хрен теряет большую часть эфирного масла и острый вкус.
Корни растения содержат эфирное горчичное масло, сахара, смолистые и азотистые вещества, аскорбиновую кислоту, минеральные соли (калий, кальций, фосфор, лизоцим и проч.). Советский ученый Б. П. Токин доказал высокую антимикробную активность хрена благодаря наличию в растении фитонцидов и лизоцима.
Корень и препараты из хрена имеют свойства: противовоспалительное, мочегонное, раздражающее, витаминное, отхаркивающее, сокогонное, фитонцидное. Хрен имеет также сахаропонижающий эффект.
Натертый хрен применяют для компрессов. Свежие листья прикладывают к больному месту при радикулите, ишиасе и невралгии.
При пониженной кислотности желудочного сока (гипоацидных гастритах), дискинезии желчных путей, нарушении моторики кишечника (атонии), холецистите, лямблиозе, а также при радикулите, плеврите, воспалении легких применяют * сок свежего корня хрена при разведении его водой в соотношении 1:3.
При заболеваниях печени, лямблиозе, гипертонической болезни показан * водный отвар хрена (1 столовую ложку свежих корней залить 200 мл воды, кипятить 5 минут, настаивать 30 минут): принимать в течение дня в объеме 1 стакана.
При холецистите, болезни Боткина также показан прием внутрь водного настоя хрена по полстакана 3 раза в день перед едой курсом 7 дней. Для приготовления * настоя 1 кг корней хрена пропустить через мясорубку, залить 3 л кипятка, настаивать в течение суток в посуде под крышкой.
При цинге, склонности к кровотечениям, физическом и умственном истощении, малярии, подагре, ревматизме следует принимать * настойку корней хрена (на 1 часть корней 5 частей водки или 70°-ного спирта) по 15 капель 3 раза в день.
В древнеиндийской медицине корни растения применяли как мочегонное и отвлекающее средство при воспалении седалищного нерва. Водный раствор хрена, чаще его сока, в соотношении 1:3 использовали для полосканий при воспалении слизистой полости рта, горла. Сок растения закапывали в уши при воспалении и гнойных выделениях. Эти рецепты актуальны и поныне.
Наружно кашицу из хрена накладывают на лицо при веснушках, пигментных пятнах, угревой сыпи, гнойных ранах и язвах.
Косметические маски из кашицы хрена и яблока, взятых в соотношении 1:1, рекомендуют при жирной себорее, вялой и дряблой коже.