В настоящее время основы судебной системы закреплены в Конституции Азербайджанской Республики от 12 ноября 1995 г.[25], которая содержит Гл. VII «Судебная власть». В развитие конституционных положений принят Закон АР от 10 июня 1997 г. № 310-IQ «О судах и судьях» (в ред. от 03.04.2015 г.)[26], а также Указ Президента АР от 17.06.1999 г. «Об организации и обеспечении деятельности судей Азербайджанской Республики»[27].
В Конституции АР отображен «принцип разделение властей», который позволяет осуществлять взаимный контроль между ветвями власти. Так, ст. 7 Конституции АР определяет, что различные ветви власти должны взаимодействовать друг с другом, и в пределах своих полномочий они независимы. Судебная власть в Азербайджане является самостоятельной ветвью власти, наряду с законодательной (гл.
V) и исполнительной (гл. VI). При этом п. 4 ст. 8 Конституции АР закрепляет, что гарантом независимости судебной власти является Президент АР.
В соответствии с п. 9 ст. 109 Конституции АР, судьи судов АР назначаются Президентом АР. В соответствии с п. 9 ст. 109 и п. 10 ст. 95 Конституции АР судьи ВС АР, ВС Нахчыванской Автономной Республики и апелляционных судов назначаются на основе представления Президента АР Милли Меджлисом АР. На должности судей высшей инстанции могут назначаться лица, как правило, проработавшие как минимум 5 лет в качестве судей судов первой инстанции. В выборах кандидатов на должность судьи Нахчыванской Автономной Республики участвует председатель Милли Меджлиса Нахчыванской Автономной Республики. Согласно ст. 135 Конституции АР, суды Нахичеванской Автономной Республики самостоятельны в решении вопросов, отнесенных к их ведению Конституцией АР и законами АР.
В соответствии со ст. 125 Конституции АР, судебная власть осуществляется посредством конституционного, гражданского, уголовного и других форм, предусмотренных законом. Судоустройство и порядок судопроизводства определяются законом. Судопроизводство должно обеспечивать установление истины. Применение не предусмотренных законом правовых средств в целях изменения полномочий судов и создания чрезвычайных судов запрещается (ст. 125 Конституции АР). В осуществлении правосудия, за исключением конституционного судопроизводства, участвуют обвинение (прокуратура) и защита.