Естественно, возникает вопрос, за счет чего архимандриту Нилу удавалось экономить выдаваемые из казны средства на содержание школы. В ревизорском отчете ответ отчасти содержится. Например, в 1832 году при семинарской больнице была устроена собственная «домашняя» аптека, для которой медикаменты частью закупались, частью готовились провизором. Выгода от аптеки была весьма значительная. Так, расходы на больницу в 1827 году составили 1500 руб.; в 1828-м – 1000 руб., а в 1829 и 1830 годах –1200 руб.; а после открытия аптеки в 1832 году – всего лишь 86 руб., в 1833 году – 211 руб., а в 1834 году (по май месяц включительно) – 54 руб. За исправной деятельностью и аптеки, и больницы строго следил сам ректор. Кстати, он же развел перед больницей ботанический садик! Кто знает, может быть, это было следствием воспоминаний о парке рядом с родной ему академией.
Экономил архимандрит Нил и на шитье сапог для семинаристов. Раньше данное дело отдавали на подряд. Так, по подряду в 1829–1831 годах за одну пару сапог семинария платила в среднем 10 руб. 76 коп. Отец Нил нанял для семинарии постоянного сапожника, и стоимость за одну пару теперь составляла всего лишь 6 руб. 35 коп. А ежегодная экономия составляла 700 руб.[34]
Впоследствии, уже будучи архиепископом Ярославским, Нил заботился о дальнейшем развитии вверенных ему духовных школ. Так, ректор Ярославской духовной семинарии Н. Тихвинский, признавая большой педагогический талант Нила, вспоминал в 1874 году, что владыка не только давал учителям свободу и простор для обсуждения разных педагогических и других вопросов, но и даже требовал с их стороны полной самостоятельности, желал и любил, чтобы каждый – учебный ли, воспитательный, хозяйственный – вопрос приучал их к самостоятельному труду[35]. Он выступал против жестоких нравов, царивших в те годы в духовных заведениях, стремился вывести из духовных училищ слишком суровое обращение с детьми и «царство розги».
В январе 1835 года архимандрит Нил был вызван в столицу на чреду священнослужения и проповеди слова Божия[36] (своего рода смотрины и проверка провинциальных архимандритов на профпригодность). И в том же году, то есть спустя десять лет после окончания академии, Нилу суждено было стать архиереем. Начать же свой архиерейский путь пришлось с Вятки. Вряд ли тогда кто-нибудь из сослуживцев отца Нила мог предположить, что пройдет меньше двадцати лет и Нил вернется в Ярославль навсегда, но уже в сане архиепископа.