По общему правилу выполнение полетов по обслуживанию «Заказчика» производится воздушно-транспортными предприятиями гражданской авиации на территории их деятельности. В случае необходимости полеты могут выполняться другими авиапредприятиями. Так, Челябинская областная клиническая больница состоит в договорных отношениях на выполнение полетов по оказанию медицинской помощи населению со Свердловским авиаотрядом Уральского управления гражданской авиации. Это обусловлено отсутствием на авиапредприятии, обслуживающем Челябинскую область, требуемых воздушных судов. Такие договоры заключаются по согласованию с командованием вышестоящего подразделения гражданской авиации (п. 12 Основных условий).
Основные права и обязанности сторон сформулированы в Типовом договоре. «Авиация» обязуется выполнять полеты по заявкам «Заказчика». Все полеты, выполняемые авиапредприятиями, подразделяются на два вида: полеты по оказанию экстренной помощи и полеты, не связанные с оказанием таковой. К последним относятся полеты по доставке специалистов для проведения плановых консультаций, по доставке медикаментов и др. Заявки на выполнение полетов первого вида должны выдаваться с пометкой «Скорая помощь» (п. 11 Инструкции), что обязывает авиапредприятие приступить к их выполнению летом не позднее, чем за 30 мин., зимой не позднее, чем за час с момента получения заявки. Это обусловлено необходимостью оказать неотложную медицинскую помощь больным как можно быстрее. В свою очередь, «Заказчик» обязуется выделять для ухода за носилочными больными и больными, требующими специального ухода в воздухе, медицинский персонал (п. 8 «з» Типового договора). Заявки, выданные на полеты второго вида, т.е. не связанные с оказанием экстренной медицинской помощи, исполняются на другой день после их подачи.
В случаях, когда санитарные задания органов здравоохранения не могут быть выполнены в силу малого радиуса действия воздушных судов, а также когда оказание медицинской помощи может быть ускорено на рейсовом самолете, «Авиация» обязана организовать перевозку носилочных больных и медицинского персонала рейсовым самолетом. При этом необходимо иметь в виду, что если болезнь включена в противопоказания к транспортировке больных на рейсовом самолете (Приложение 1 к Инструкции), то подобную обязанность «Авиация» не несет. Погрузка больных и грузов на аэродромах вылета и в пункте вызова, их выгрузка производится силами и средствами учреждений здравоохранения под наблюдением медицинского персонала в присутствии одного из членов экипажа или авиатехника (п. 17 Инструкции). Выполнение полетов по оказанию медицинской помощи населению осуществляется «Авиацией» на самолетах (пассажирский вариант), приспособленных для транспортировки больных и медицинского персонала. Однако подобное требование на практике соблюдается не всегда. Например, в Казахском управлении гражданской авиации были случаи, когда для выполнения полетов направлялись самолеты после проведения авиационно-химических работ, неприспособленных для перевозки больных.