Если сумма учтенных при исчислении налоговой базы по единому налогу расходов на приобретение основных средств и нематериальных активов превышает сумму амортизации, начисленную в соответствии с гл. 25 НК РФ, то полученная разница между этими суммами включается такими налогоплательщиками в состав доходов, учитываемых при исчислении налоговой базы по налогу на прибыль организаций.
При переходе налогоплательщика с УСН на общий режим налогообложения суммы НДС, предъявленные налогоплательщику, применявшему УСН, при приобретении им товаров (работ, услуг), которые не были включены в расходы при исчислении налоговой базы при применении УСН, принимаются к вычету в порядке, предусмотренном гл. 21 НК РФ для плательщиков НДС (п. 6 ст. 346.25 НК РФ). Согласно п. 1 ст. 171 НК РФ плательщик НДС имеет право уменьшить общую сумму налога, исчисленную в соответствии со ст. 166 НК РФ, на сумму налоговых вычетов (ст. 171 НК РФ). При этом п. 2 ст. 171 НК РФ установлено, что суммы НДС, предъявленные налогоплательщику при приобретении товаров (работ, услуг) на территории Российской Федерации, подлежат вычетам при использовании этих товаров (работ, услуг) в операциях, облагаемых НДС.
Таким образом, при переходе налогоплательщика с УСН на общий режим налогообложения вычету в установленном порядке подлежат суммы НДС по товарам (работам, услугам), приобретенным, но не использованным при применении УСН.
В связи с этим при переходе индивидуального предпринимателя с УСН на общий режим налогообложения суммы НДС по товарам и материалам, оплаченным и приобретенным, но не использованным в период применения УСН, принимаются к вычету в общеустановленном порядке в первом налоговом периоде, в котором индивидуальный предприниматель перешел на общий режим налогообложения.
Что касается процедуры отнесения тех или иных сумм на расходы или доходы фирмы при переходе с УСН на общий режим по налогу на прибыль, то для тех компаний, которые впоследствии выбрали метод начисления, процедура будет выглядеть следующим образом: если они до момента перехода с «упрощенки» проводили операции по реализации, или, наоборот, по приобретению товаров или услуг, однако не успели получить оплату, или, соответственно, сами оплатить купленное, то такие доходы и расходы фирма сможет принять в месяце перехода на метод начисления.