В Бутырской тюрьме произошло важное счастливое событие: Н. Е. Пестов познакомился с прихожанином церкви Святителя Николая на Маросейке.
Настоятелем церкви был известный своим благочестием старец отец Алексий Мечёв, в то время уже старый и больной человек. Духовное руководство в приходе постепенно перешло к его сыну о. Сергию Мечёву.
По благословению старца о. Алексия Николай Пестов стал духовным сыном о. Сергия Мечёва, мудрого и благочестивого пастыря. Маросейский старинный храм стал вторым домом Н. Пестова, он перестал посещать обновленческие храмы.
По благословению духовного отца Н. Пестов стал в храме кем-то вроде старосты.
Примерно в это время он начал приучать себя творить Иисусову молитву.
Тогда же Н. Пестов принес так называемую «генеральную исповедь» грехов всей прожитой жизни.
Летом 1926 года Николай Пестов со своим другом, тоже духовным сыном о. Сергия Мечёва, Колей Иоффе совершил поездку в Саров и Дивеево.
В конце 1926 года по ходатайству Зои Вениаминовны ей, как ведущему инженеру и ударнице труда, была предоставлена от Московского Алкалоидного завода отдельная 3-комнатная квартира на ул. Карла Маркса (бывшая ст. Басманная).
8 октября 1927 года в ней родился третий ребенок – сын Сергей. Первый, сын Колюша, родился 18 февраля 1924 года, еще в общежитии МВТУ. 8 сентября 1925 года в маленькой однокомнатной квартирке родилась дочь Наталия.
В начале апреля 1931 года, в канун Благовещения, храм св. Николая на Маросейке был закрыт. Приход с настоятелем о. Сергием Мечёвым прекратил свое существование. (О. Сергий Мечёв погиб в 1941 г. в Ярославле). В последующие годы любимые храмы Н. Пестова закрывались один за другим, и перед войной он уже не ездил ни в какую церковь. Дома иконы попрятали в шкаф за занавеску. В те годы Пестовым приходилось тщательно скрывать свои убеждения. Оставшиеся священники скрывались и тайно совершали требы по квартирам своих духовных детей. Иногда богослужения совершались в квартире Пестовых.
Детям запретили в школе упоминать о вере. За религиозное воспитание родителей могли снять с работы. «Непионерство» дети переживали тяжело, но без обиды на родителей. Н. Пестов никогда не жалел времени на общение с детьми. Он подолгу беседовал с ними, сочинял детские игры, ходил на каток, играл в бадминтон, в теннис, в крокет, волейбол, учил детей плавать, катался с ними на лодке. В дни ангела и на Рождество в семье устраивались праздники, в гости приходили дети знакомых верующих людей. Одноклассников в гости не звали.