В погребении о. Иоанна участвовали десятки тысяч людей. Необычайные это были похороны! На всем пространстве от Кронштадта до Ораниенбаума, и в Петербурге – от Балтийского вокзала до Иоанновского монастыря на набережной реки Карповки – стояли огромные толпы плачущего народа. Такого количества людей не было до того времени ни на одних похоронах – это был случай в России совершенно беспримерный. Похоронное шествие сопровождалось войсками со знаменами, военные оркестры играли «Коль славен», а тысячи верующих, растянувшиеся за серебряным катафалком на многие километры, единым хором пели погребальное «Святый Боже…» На всем пути через город по обеим сторонам дороги шеренгами стояли войска. Чин отпевания совершал С.-Петербургский митрополит Антоний, во главе сонма епископов и многочисленного духовенства. И хотя заупокойная служба сопровождалась общими рыданиями людей, чувствовавших себя осиротевшими, она напоминала собой скорее светлую пасхальную заутреню, – и чем дальше шла служба, тем это праздничное настроение у молящихся все росло и увеличивалось. Чувствовалось, что из гроба исходит особая благодатная сила и наполняет сердца присутствующих какой-то неземной радостью. Для всех было ощутимо ясно, что во гробе лежит Святой, Праведник, и дух его незримо пребывает в храме, объемля своей любовью и лаской всех, собравшихся отдать ему последний долг…
В последующие годы, вплоть до революционного переворота и начала гонений, в Иоанновском монастыре у гробницы святого Иоанна каждый день непрерывно служились панихиды, на которых совершались многие чудеса исцелений. Даже когда в 1923 году монастырь был закрыт, а его помещения отданы под светские организации и коммунальные квартиры, паломничество к месту погребения о. Иоанна не прекращалось: верующие приходили к стене монастырского здания, где внизу, в подвальном этаже, находилась гробница о. Иоанна, и возле окошечка молились ему, высказывая наболевшие нужды и прошения.
С 1990 года, когда о. Иоанн Кронштадтский был причислен Русской Православной Церковью к лику святых, – у гробницы его, в нижнем храме-усыпальнице восстанавливаемого монастыря, новопрославленному святому стали ежедневно служиться молебны. Вновь, как и прежде, непрерывный поток паломников со всех концов России и из-за рубежа стекается к Батюшке Иоанну Кронштадтскому, чтобы поклониться ему и испросить его молитвенной помощи в нуждах и бедах, – и как и прежде, совершаются здесь чудеса телесных и душевных исцелений и становятся услышанными искренние сердечные молитвы…