В послевоенные годы проект пытались реанимировать, и поезда вновь повезли народ в Биробиджан. Однако и вторая попытка ничем не закончилась. Какой-то минимум осел, а все остальные правдами и неправдами старались эмигрировать совсем в другие края и страны.
В 53-м году поднялась антисемитская волна, связанная с «заговором врачей». Над евреями сгустились тучи. Врач Лидия Тимашук привлекла внимание к лечению товарища Жданова, в результате которого он умер, и началось расследование. Немедленно было заявлено, что «большинство участников террористической группы… были… завербованы филиалом американской разведки – международной еврейской буржуазно-националистической организацией “Джойнт”. Грязное лицо этой шпионской сионистской организации, прикрывающей свою подлую деятельность под маской благотворительности, полностью разоблачено». Все подозреваемые были арестованы, а Тимашук за помощь «в разоблачении трижды проклятых евреев» получила орден Ленина. Дело закончилось со смертью Сталина. За три дня до инсульта он заявил в прессе, что: «борьба против сионизма не имеет ничего общего с антисемитизмом. Сионизм – враг трудящихся всего мира, евреев не менее, чем не евреев». Кампанию быстро свернули, арестованных врачей выпустили, а через несколько дней Сталин умер. Смерть помешала многим его планам – например, переселению в Биробиджан всех евреев Советского Союза поголовно. Так «Красный Сион» и не стал реальностью.
Вообще, надо сказать, что сам Сталин крайне противоречиво вел себя в отношении «еврейского вопроса». С одной стороны, ему принадлежат, например, такие слова: «Антисемитизм как крайняя форма расового шовинизма является наиболее опасным пережитком каннибализма. Антисемитизм выгоден эксплуататорам как громоотвод, выводящий капитализм из-под удара трудящихся. Антисемитизм опасен для трудящихся как ложная тропинка, сбивающая их с правильного пути и приводящая их в джунгли. Поэтому коммунисты как последовательные интернационалисты не могут не быть непримиримыми и заклятыми врагами антисемитизма. В СССР строжайше преследуется антисемитизм как явление, глубоко враждебное советскому строю» (ответ на запрос Еврейского телеграфного агентства из Америки, январь 1931 г.).
С другой стороны, в неофициальной среде он мог позволить себе заявить, что «мы теперь всех жидов из Политбюро удалили».