В июне 1944 года Кожедуб назначен на должность заместителя командира 19-го истребительного авиационного полка, воевавшего в составе 1-го Белорусского фронта, а уже в августе становится дважды Героем Советского Союза, доведя свой личный счет до 46 побед (в том числе за один день 3 июня сбив три немецких истребителя Fw.190).
Личный состав 19 иап, в августе 1944 года преобразованного в 176-й гвардейский истребительный полк, вел действия методом «свободной охоты». Самостоятельно находя цель, летчики вступали в бой, как правило, против имеющего значительное численное преимущество противника. Сам Иван Никитович в своих мемуарах вспоминал бой 12 февраля 1945 года, когда ведомая им группа из шести истребителей вступила в бой с тридцатью истребителями-бомбардировщиками Fw.190. Потеряв один самолет, советские истребители сбили восемь машин противника, причем три из них – лично Кожедуб.
А последние два «фокке-вульфа» майор И. Кожедуб внес в список своих побед 17 апреля 1945 года, когда в паре со своим ведомым Дмитрием Титоренко атаковал строй Fw.190 численностью до авиагруппы (полка). Последнюю из шести побед одержал в этом бою и кавалер трех орденов Красного Знамени, Александра Невского и Отечественной войны майор Дмитрий Титоренко.
Описание боевого пути И.Н. Кожедуба, как это зачастую бывает, изобилует рядом красочных подробностей, не все из которых подтверждаются фактами. Так, достаточно часто приводится утверждение, что в апреле 1945 года советский ас сбил пару по ошибке атаковавших его американских «мустангов» Р-51. Правда, документальных подтверждений этому нет – в мемуарах Ивана Никитовича по понятным причинам этот эпизод не отображен, и единственным свидетельством являются упоминания об этом бое писателем Н. Бодрихиным, публикуемые же иногда кадры фотопулемета вызывают сомнения в достоверности, поэтому утверждать однозначно о его подлинности достаточно сложно.
В течение длительного времени утверждалось, что в числе побед И. Кожедуба значился и реактивный истребитель Ме.262. Однако установить факт принадлежащего к конкретной группе люфтваффе на данном участке фронта на указываемую дату самолета не удалось, достаточно неопределенно и описание этого боя самим советским асом. Кроме того, данные о воздушной победе над реактивным самолетом, как было выяснено М. Быковым в ходе его исследований, были вписаны в послужной список Кожедуба «задним числом». Не исключено, что при определении цели как реактивный истребитель советские асы, только слышавшие о появлении в люфтваффе реактивных истребителей, просто ошиблись. В частности, высказывается предположение, что за «мессершмитт» с реактивными двигателями» Кожедуб и его ведомый Д. Титаренко могли принять истребитель Bf.109 с подвешенными под крыльями направляющими неуправляемых ракет Wfr.Gr.21, нечасто применявшимися на Восточном фронте и советским летчикам незнакомыми.