20 декабря 1999 (в «день чекиста») В.Путин восстановил памятную плиту в честь Ю.Андропова на стене здания КГБ в Москве.
31 декабря 1999 подписал правительственное распоряжение о восстановлении начальной военной подготовки в школах.
31 декабря 1999 президент Ельцин в своем предновогоднем обращении заявил об уходе в отставку с поста президента с назначением (в соответствии с конституцией) В.Путина и. о. президента до проведения досрочных выборов. В первых числа января 2000 года В.Путин издал указ об иммунитете первого президента России и членов его семьи от любых судебных и административных преследований.
26 марта 2000 избран президентом, получив, согласно официальным данным, 39 740 434 голосов избирателей (52,94%).
* * *
В мае 2000 года началась атака прокуратуры и силовых структур на телекомпанию НТВ, не поддерживавшую В.Путина в ходе президентских выборов. 11 мая были проведены обыски в офисах компании «Медиа-Мост» Владимира Гусинского, 13 июня В.Гусинский был арестован (16 июня освобожден под подписку о невыезде), а 20 июля в обмен на закрытие уголовных дел и снятие ареста с имущества был принужден к письменному обещанию продать НТВ и остальные СМИ «Медиа-Моста» принадлежащему государству «Газпрому».
13 мая 2000 Путин подписал указ о создании 7 федеральных округов и полномочиях представителей президента в округах.
20 сентября 2000 посетил Александра Солженицына в его доме и имел с ним длительную беседу.
В апреле 2001 была завершена операция по выводу телекомпании НТВ из собственности В.Гусинского и переводу ее под контроль полугосударственного «Газпром-медиа» (несогласные с новым состоянием телекомпании группа Е.Киселева переместилась на канал ТВ-6 Б.Березовского).
10 июля 2001 подписал дополнения в закон «Об охране окружающей природной среды» (окончательно принятые Думой 6 июля), которые разрешили ввоз на территорию РФ ядерных отходов.
В ночь с 21-е на 22-е января 2002 телевещание ТВ-6 было прекращено.
* * *
23 октября 2002 банда чеченских террористов захватила около 800 заложников во время представления мюзикла «Норд-Ост» в ДК на Дубровке, требуя вывода российских войск из Чечни. 26 ноября 2002 В.Путин распорядился о штурме ДК с применением отравляющего газа. В ходе операции по уничтожению террористов вместе с террористами погибли 130 заложников.